企业小工的工资应该通过发放工资单的方式进行入账。企业需要在每个月底或者每个支付周期结束时，将每个小工的工资计算并填写在工资单上，然后发放给小工。在发放工资的同时，企业需要将这些记录保存起来，以备下一次稽核或者审计。这种方式可以保证企业的财务记录准确，也可以让小工清晰地了解到自己的薪资情况。