1、位置不同：芜湖南站位于中国安徽省芜湖市弋江区境内，而芜湖站位于中国安徽省芜湖市镜湖区文化路18号。2、时间不同：芜湖南站始建于2013年，而芜湖站始建于1992年。3、线路不同：芜湖南站主要线路为宁安高速铁路和合杭高速铁路，而芜湖站主要线路为淮南铁路、宁芜铁路、芜铜铁路、皖赣铁路、宁安高速铁路、商合杭高速铁路。