深化全面预算管理的主要原则包括：1.全面性原则：预算管理应该覆盖所有收支和资产负债的方面，包括政府机构、国有企业和公共机构等各个领域。2.绩效导向原则：预算应该以绩效为导向，注重预算的实际效果和成果，以及与政策目标的一致性。3.公开透明原则：预算应该公开透明，促进政府行为的公开透明和公众参与。4.责任追究原则：预算管理应该落实责任追究机制，对预算执行情况进行监督和评估，并对不良行为进行追究和惩罚。5.风险管理原则：预算应该考虑各种风险因素，制定相应的措施来规避风险，保障预算执行的安全性和稳定性。6.灵活性原则：预算管理应该具有一定的灵活性，能够根据实际情况进行调整和变更，以适应不断变化的经济和社会环境。