水族馆有三只龟，登记表中也应该显示为三只。一般来说，一个登记表是用来记录某项事物的数量或状态的，就算在实际情况中有变动，也应该及时更正和更新，以保证登记表数据的准确性和完整性。因此，即使这三只龟中有一只离开或新增，登记表上的记录仍然应该按照实际数量进行。