《农政全书》的目录一共包括12章，其中有：第一章《王佐之学》，介绍了正确和异常的政治行为，并为政令和财务制定了原则；第二章《耕作法》，论述了耕作的时机、方式、实施和工作量；第三章《田民之礼》，规定了土地等领域的法律关系，以及官员和耕作者之间的义务和权利；第四章《牧畜之道》，论述了养殖牲畜的知识和方法：第五章《农具》，介绍了各种农具的设计、生产和使用；第六章《障碍》，探讨了政府对农业发展的阻碍；第七章《林木》，介绍了各种重要树木的生长条件和管理技术；第八章《园林》，介绍了各种庭院园林的设计因素和保护技术；第九章《水利》，探讨了水库的施工、维护和利用；第十章《堤防》，介绍了治理洪涝的传统技术；第十一章《渔猎》，论述了海洋和水域渔业的发展；第十二章《蝇责》，主要介绍了及早拆除蝇虫的方法。
