清华大学校长的职位比云南省省长的职位大。因为清华大学是中国最高学府，是国家重点大学之一，具有较高的学术地位和社会地位。因此，校长的职位要比省长的职位更加重要和尊严。另外，清华大学校长不仅负责学校管理工作，还要直接对接国家统筹框架，负责政府宏观调控和决策，具有与省长同等的地位。