b站删除了《刀剑神域》第1季第2话至第21话、第2季第1话至第7话、第3季第1话至第3话、第6季第1话至第4话。这些被删减的剧集中包括了一些重要的内容，包括关于主角的家庭背景、出现的重要节令、以及一些角色之间的故事线。原因是当时剧集引起了太多关注或讨论，而这些都是由于其中含有对政治、宗教等象征物的暗示，以及社会上的一些热点问题。