一般来说，福建工程学院暑期实习是否会进档案取决于具体情况。通常情况下，学校会将学生的实习经历记录在个人档案中，以备将来参考和使用。但是具体操作可能会因学校的不同而有所差异，您最好咨询一下福建工程学院的教务处或学生事务部门了解相关政策规定。