眼咽型肌营养不良症基因位于染色体 14 q 11.2-13,其蛋白产物为多聚腺苷酸结合蛋白 2(polyade-nylate-binding protein 2 , PABP2) ,故也称多聚腺苷酸结合蛋白 2 基因。PABP 2 蛋白存在于细胞核中,对信使 RNA 起增加 poly(A) 的作用。发病机制与 PABP 2 基因 1 号外显子上的 GCG 重复突变增加有关:正常人仅 6 次重复,而眼咽型肌营养不良症患者 GCG 重复 8~13 次,编码异常的多聚丙氨酸链。重复的次数越多,症状越重。