酸性清洗剂：在继续使用原有酸性清洗剂的基础上，使用分析纯盐酸代替工业盐酸，并将酸性清洗液pH控制在2.0左右，通过提高清洗液的温度来加快清洗剂反应和清洗的效率。
碱性清洗剂：在继续使用原有碱性清洗剂的基础上，使用分析纯氢氧化钠代替工业烧碱，并将碱性清洗液pH控制在12.0左右，通过提高清洗液的温度来加快清洗剂反应和清洗的效率。
此外，针对可能出现的有机物和微生物污堵的情况，在每次常规化学清洗后，还要使用非氧化性杀菌剂对系统进行消毒和杀菌处理，保证膜元件表面在运行初期不会出现有机物和微生物附着现象。保证反渗透系统长期稳定运行，提高系统运行寿命。