整个忍界大战由15个关卡(敌人)组成，每个关卡之间有一个宝箱，每通过一个关卡可以打开一个宝箱。玩家进入关卡后看到左侧站立着自己的忍者小分队，玩家点击“搜索”以后，就会碰到敌人，这些敌人都是从系统中匹配的玩家。在进行战斗之后并获胜之后玩家们就会获的宝箱。