根据我所了解到的信息,运城学院的学生跑操是由学校统一组织的,而不是由体育部自行组织。至于为什么有的院系跑操,有的不跑,这可能是学校根据不同院系的情况和安排所作出的决定。此外,关于为什么有些专科学院强制学生跑操,而有些则不强制,这可能取决于各个专科学院对于学生健康和身体素质的重视程度。一些院校可能认为强制学生跑操对于提高学生的身体素质和健康水平有积极作用,因此会采取这种措施。然而,其他院校则可能选择不强制学生跑操,因为它们可能认为学生应该有权自主选择是否参与体育锻炼。总之,学生跑操的安排和实施可能因不同学校和不同院系的情况而有所不同。如果你对于自己所在学校的具体规定有疑问,建议你向自己的辅导员或学校相关部门咨询。