研究论文的方法部分（method）应该包括什么？
研究论文中一个经常被误用的术语是“方法论”（methodology）。方法论是指科学哲学的一个分支，它涉及科学方法，而不是方法本身，因此作者应避免使用它。以下是应包含在研究论文方法部分中的主要小节列表；作者可能会更清楚地使用副标题来描述他们的研究。
文献检索：作者应该引用任何有助于他们选择方法的来源，以及使用的研究数据工具比如文本本挖掘工具。作者应指明过去研究的时间范围及其特定参数。
文献梳理：如果某论文仅仅使用文献梳理的方法，则需要说明梳理流程怎样？使用何种方法比如使用软件工具甚至使用人工智能算法等采集文中数据？具体怎么梳理文献得到该文所需要的数据并进行编码、整理、分析的？数据可否共享和其他学者再利用？
研究参与者：作者应该引用他们收到任何非人类受试者的来源。应列出使用的动物数量、年龄、性别、它们的初始条件以及它们的饲养和照料方式。如果是人类主题，作者应提供特征，例如地理位置；他们的年龄范围、性别和病史（如果相关）；和科目的数量。如果使用医院记录，作者应在研究开始时包括受试者的基本健康信息和生命统计数据。作者还应说明每位受试者都提供了书面知情同意书。
纳入、排除标准：作者应描述他们的纳入和排除标准，它们是如何确定的，以及有多少受试者被淘汰。
组特征（可与结合研究参与者一起叙说）：作者应描述所选组如何划分为子组及其特征，包括对照组。作者还应描述使用的任何特定设备，例如住房需求和饲料（通常用于动物研究）。如果对患者记录进行审查和评估，作者应提及审查人员是否对其不知情。
过程或程序：作者应描述他们的研究设计。必须解释任何必要的准备工作（例如，组织样本、药物）和仪器。作者应该描述受试者如何“被操纵来回答实验问题”。应包括时间表以确保程序清晰（例如，“大鼠被给予 XX 药物 14 天”）。对于处死的动物，应概述使用的方法和遵循的协议。
统计分析：应该描述数据的类型、它们是如何测量的以及进行了哪些统计测试。注意：这不是“结果”部分；任何相关的表格和数字都应该在后面引用。必须引用使用的特定软件。
在撰写研究方法时注意避免无助研究的背景信息。避免提供很多关于人类受试者的细节。作者应该更多地关注他们的方法如何用于满足他们的目标而不是机制。方法的局限性以及它们如何被克服的（通常在您的“研究局限”一章中讨论）。这将有助于验证结果。
一个深思熟虑的方法部分是期刊稿件中最重要的部分之一，其中研究数据是关键，现在美国大于50万美元的研究项目在申请基金时都必须提交研究数据管理计划（data management plan），研究成果出来后，有些出版商也要求提供研究数据以供共享和再使用。
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