先说基础：我认为，新剧场版是旧剧场版中明日香说完“真恶心”后，重启的世界。所有人都从橙汁变回了人类，这一点，动画中剧情的变动，各种细节的不同都说明了这个世界是与TV版完全不同的世界。轮回是在解释为什么世界与之前不同。
在前作真嗣补完后，心灵应当是收到了修复。在新剧场版中，他更开朗，主动去接触他人（如去海洋馆时主动去了解凌波零）。一切都表明他与之前的的真嗣有了不同，虽然整体和之前没什么不同
这样以来，为什么真嗣性格变化就说得通了。但是，也有其他的结论，那就是平行宇宙（其实就是庵野秀明想出来的另一条故事线）。它在设定上与eoe有很大不同，比如新剧场版中第一个出场的使徒是第四使徒而不是第三使徒。也就是说，这根本没有任何依据，就是庵野秀明脱离前作构造的一个全新世界。
以上仅是一个刚刚入坑的新人的浅显看法，如果有不对的地方欢迎大家指正