烟台南山学院的三方协议是毕业生、用人单位和学校之间就学生就业方向签订的一种协议，由三方共同签署后生效。具体来说，三方协议的作用是明确毕业生、用人单位、学校三方在毕业生就业工作中的权利和义务的书面表现形式。其中，毕业生与用人单位经过双向选择达成就业意向后，必须签订学校统一发放的《高校毕业生、毕业研究生就业协议书》，毕业生与用人单位签订的其它就业协议书无效。在签订三方协议时，需要注意以下事项：1. 毕业生必须取得毕业资格，否则用人单位可以不予接收而无须承担法律责任。2. 填写用人单位名称时，务必注意是否与单位的有效印鉴上的名称一致，如不一致，协议无效。完成这些步骤后，三方协议就完成了。需要注意的是，就业协议在毕业生到单位报到、用人单位正式接收后自行终止，劳动合同则是毕业生上岗后从事何种岗位、享受何种待遇以及相关的权利和义务的法律依据。