根据我所了解的山东自考的规定,理论课程和实践课程的成绩是分别计算的。当你通过所有的理论课程后,你可以获得相应的毕业证书和学位申请资格。如果你已经通过了大部分的理论课程但有几门课的成绩达不到学位要求,你仍然可以继续参加实践课程的考试并取得其合格的成绩。但是需要注意的是,在计算学位要求的分数时,只考虑你在规定时间内完成的学分(包括理论和时间)的综合得分是否达到标准,而不关注具体是哪几门课或者是在什么时间段内获得的成绩。因此即使你的部分理论课程的分数没有达标,只要你总体的学分化符合学位的要求并且其他条件也满足的话也可以正常地获得学位。