新剧本会覆盖老剧本，剧本修改武将要在游戏中专门设置编辑武将影响，否则会出现类似程咬金武力61，智力83的情况

十多年前我用VAN修改器修改过，有说错的地方见谅。
剧本在游戏目录scenario文件夹里，原版里加上威力加强版新增的合计14个剧本文件，在文件夹里以scenario1-14的序号存在，如果你电脑文档的koei文件夹里三国志11游戏还没通过关，有些剧本在游戏里是没有显示的，如英雄集结（通关一次），女流之战（需要制霸模式全通）等等，但是在剧本文件里可以看到这些隐藏剧本也可以修改，所以最好还是找一个网上的完美全通的系统存档覆盖你原来的，或者就麻烦点作弊把制霸模式通关了。
新增修改剧本要想不影响改动原有剧本的话最好还是以“另存为”方法来增加，游戏本体实际还是留有了空白的剧本位置的，你可以随便找一个剧本然后把它的scenario序号改为scenario15或者16，然后再在上边该你需要的要素即可，注意只能有15-16两个，17序号以后无法在游戏里显示，再新增只能动原有的剧本了。
在你改动的剧本里可以修改原有的多数人物要素，而且不影响其他剧本的，但是如果想更完美把改动过的人物列传也改了，这个就需要麻烦点通过在meg文档里按照排列规律慢慢找了，但是要注意改了列传对应人物的列传信息也都会改变，这个是影响全局的。