一般剂量每日 5 mg/kg，或 150 mg/m²，最大不超过 200 mg/m²。由于其有效剂量与中毒量接近，故常需监测血浓度（ 50～300 mg/ml）以调整剂量。
环孢菌素 A 可用于对激素治疗有效应但毒副作用大，致患儿不能耐受者。停药后虽可复发，但再用仍常奏效。对激素耐药者，如尽早应用，则部分患儿可缓解。对激素耐药者隔日小量激素似有助于增加缓解率；对激素依赖者，单用本药多可使肾病缓解；此外对生长期小儿及激素毒副作用显著者则以单用为宜。