南京人才安居购房补贴的申请流程如下：
1. 查询是否符合申请条件。需要登录南京市人才安居信息服务平台，查询就职企业是否属于平台注册企业，若查询无此企业，则无法申请人才安居补贴，只可以转向申请租房补贴。同时，需要查询自己是否属于人才分类中的A~F类。
2. 准备相关材料。国内高校毕业生提供毕业证书、学位证书、教育部学历电子注册备案表（非学籍验证报告）；国（境）外高校毕业生提供教育部留学服务中心国（境）外学历学位留学认证。身份证（正、反面）、劳动合同（首页、签订时长页、盖章签字页）、社保缴纳证明（省属企业需同时提供省养老保险缴纳证明）。
3. 前往南京市人才安居信息服务平台进行补贴申请。
请注意，对于不同类型的人才，补贴的申请标准和流程可能有所不同。因此，具体操作步骤和申请材料可能需要根据您的个人情况进行调整。如有疑问，建议咨询南京市人才安居办公室或相关机构以获取准确信息。