公安机关在案件侦查结束后，会将相应的材料移送检察院，由人民检察院根据材料进行审核，并且最终做出是否起诉的决定。检察院经过考量后，既有可能提起公诉，也有可能做出不起诉决定。那么如果检察院决定不予起诉，公安机关还能进行行政处罚吗？
检察院认为其罪行尚不构成犯罪，做出不起诉决定后，检察院认为依法应当给予行政处罚的，可以提出检察建议或者司法建议，移送有关行政执法机关处理。如果之前已经被刑事拘留过，刑事拘留期限可以折抵治安拘留期限。

法律依据如下：
《刑事诉讼法》
第一百七十七条　【法定不起诉的条件】犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者有本法第十六条规定的情形之一的，人民检察院应当作出不起诉决定。
【酌定不起诉的条件】对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。
【不起诉案件的处理】人民检察院决定不起诉的案件，应当同时对侦查中查封、扣押、冻结的财物解除查封、扣押、冻结。对被不起诉人需要给予行政处罚、处分或者需要没收其违法所得的，人民检察院应当提出检察意见，移送有关主管机关处理。有关主管机关应当将处理结果及时通知人民检察院。

第一百八十条 对于有被害人的案件，决定不起诉的，人民检察院应当将不起诉决定书送达被害人。被害人如果不服，可以自收到决定书后七日以内向上一级人民检察院申诉请求提起公诉。人民检察院应当将复查决定告知被害人。对人民检察院维持不起诉决定的被害人可以向人民法院起诉。被害人也可以不经申诉，直接向人民法院起诉。人民法院受理案件后，人民检察院应当将有关案件材料移送人民法院。

另外，如果公安机关认为人民检察院不起诉的决定有错误，可以要求复议，如果人民检察院还是决定不予起诉的话，这时可以向上一级的人民检察院提请复核。
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