日本留学签证的申请流程通常包括提交申请材料、缴纳学费、获得在留资格认定书和最终的签证申请。首先，申请人需要向日本的学校提交申请表格和相关材料，如学历证明、日语能力证明等。学校审核通过后，会发放在留资格认定书，这时申请人需要支付学费并将认定书提交到日本驻当地大使馆或领事馆进行签证申请。学习谷的留学顾问可以全程指导学生准备材料和办理手续，确保每一步都顺利进行。