《神秘海域1》一共有22个章节。游戏具体章节名如下：
1.第一章开始冒险。
2.第二章黄金乡的探索。
3.第三章惊奇发现。
4.第四章坠机现场。
5.第五章壁垒。
6.第六章过去的真相大白。
7.第七章逃走。
8.第八章失落的都市。
9.第九章前往高塔。
10.第十章海关小屋。
11.第十一章一场激烈冲突。
12.第十二章逆流而上。
13.第十三章圣殿？
14.第十四章前往地底。
15.第十五章在往宝藏的路上。
16.第十六章宝藏保管库。
17.第十七章宝藏保管库的心脏。
18.第十八章地下碉堡。
19.第十九章不速之客。
20.第二十章拯救竞争。
21.第二十一章黄金与骸骨。
22.第二十二章一决高下。

《神秘海域4》共有22个章节。此外，游戏还包括序章和终章，使得总章节数达到24个。《神秘海域4：盗贼末路》的每个章节都有其独特的特点和故事背景，这些章节紧密相连，共同构成了一个引人入胜的故事。
游戏的故事背景设定在《神秘海域3：德雷克的诡计》事件发生后的数年，主角内森·德雷克已经从宝藏猎人退休，但他的哥哥山姆却卷入了一场阴谋之中。为了帮助山姆，内森踏上了寻找传说中的海盗宝藏的旅程。
游戏的剧情紧凑且场景多变，没有一个镜头是浪费的。探索、解谜和战斗各占三分之一的戏份，确保了玩家在享受故事的同时也能体验到丰富的游戏内容。从第三章开始，游戏的节奏明显加快，情节也变得更加紧张刺激。
此外，《神秘海域4》的故事核心围绕欺骗、矛盾与和解展开，探讨了无尽的宝藏与真正珍贵的事物之间的关系。游戏中还涉及到了真实历史人物Henry Every的传奇生涯，这位17世纪臭名昭著的海盗成为了游戏的重要灵感来源。
游戏的场景从印度洋上的东非国家贯穿到各种白雪皑皑的室外，兄弟两人将会对抗反派，展开一场惊心动魄的冒险。顽皮狗将故事背景搬到了神秘的东方国度印度，吸引了大量玩家的关注。