不能，或者给你换个问题，你觉得神明能不能用只摧毁拟像的方式干死法师

你这个问题就好比说：我可不可以在不杀死一个人的前提下杀死一个人？你这个条件和要求就是背道而驰的啊

你是想问：神明能不能在发现巫妖的同时锁定他的命匣，并且超时空打击给他身体和命匣一起炸了
还是想问：神明有没有办法不靠找命匣，以巫妖实体为目标直接把他抹除，并且此后命匣也失去复活能力

答案是看剧情需要。
臭名昭著流毒无穷的星光月刃大多数神祇摧毁起来麻烦但艾达丝这个弱等神力一碰就碎。
同理只要作者想，随便哪个神都能抱喝一声"竖子受死"把巫妖从人到盒全碾压了。
但既然这样，为何DM要搞个巫妖BOSS呢？
选巫妖不就是为了下次还能用么？

巫妖是通过灵魂复活的，你击碎肉体后在灵魂和命匣选一个搞定就好了，灵魂用缚魂术之类的，命匣可以用预言系找

小说里设计一个能依靠命匣或者魂器或者面具或者任何身外之物无限复活的BOSS，就是为了多次利用。神不是没能力破坏命匣，而是剧情没要求破坏命匣。
建议参考：克尔苏加德，伏地魔，杰森

神是背景板，dm说可以就可以，dm说不行就不行，取决于dm编故事的剧情需要。

参考伏地魔

看dm怎么想。卡密既可以可以直接连着灵魂之间的联系一起摧毁命匣，又可以对巫妖的命匣无可奈何

网文挺常见的，大能双眼一瞪直接把对面连概念都抹除了

取决于剧情需求

目测灵魂本质的可以，大力神不行

萨马斯特不就是靠巫妖才从几个神手底下活下来的吧

可以，具体看dm心情