在某个遥远的平行世界中，这个世界的主题旋律是魔法少女。
面对魔兽、邪恶组织、异世界人等存在的威胁，许多少女通过各种各样的方式变身成为拥有强大魔法能力的姿态，守护世界、打败敌人。虽然变身力量的来历各不相同，但她们都被称为魔法少女。
如名字一样，所有的魔法少女都是女性……除了一个例外。
顺带一提，这个世界的法则是：掌握魔法的人会逐渐发癫，越癫越强，只有魔法少女除外。除非以魔法少女的方式（变身后）使用魔法，任何魔法师都会开始发癫，舍弃魔法才能恢复正常。
「……所以你说，你叫神净讨魔？」
某一天，一位少年——对，身为初中三年级男性的上条当麻，遇到了某个涉及邪恶组织的危险事件。在这次事件中，他遇到了比自己年龄小的大小姐蜜蚁爱愉，并为了保护她而战斗。
然而没有力量的上条终究不是邪恶组织的对手，被打入濒死状态，并在失去意识前眼睁睁看着蜜蚁遇到危险。
在意识的黑暗中，上条在自己的精神世界见到了一条龙王。
「————！」
龙王并不会口吐人言，但上条还是明白了它的意思：它可以给上条力量，但只能通过契约，让上条成为魔法少女来达成。
……上条也不是没听说过魔法少女的事情，但男性可以变成魔法少女他还是第一次听说。
然而现实已经刻不容缓，蜜蚁已经危在旦夕。
「那就来吧，给我能够拯救大家的力量！不管要什么样的代价都行！」
上条伸出手，触碰龙王的额头。
契约成立。
现实中，上条倒下的身体发出耀眼的光芒，将邪恶组织的战斗员和魔兽们吹飞。倒在旁边的蜜蚁惊讶地看着这道光芒，只觉得心里非常温暖。
光芒中，上条的身体快速变化着，他男性的姿态逐渐消失，变成了明显女性的形象。
刺猬头披散下来，变为柔顺、飘逸的黑色长发，面容从普通长相变成了顶级美少女的形象，身高没有变化，皮肤却变得白皙、嫩滑，身体轮廓收缩，胸部和臀部却变得丰满起来。
黑色和红色为主的魔法少女服装在她身上显现，华丽的连衣裙装和黑色的丝袜覆盖在她身上，然后是发饰、颈饰，以及两只互不对称的手套。左手的手套只是华丽漂亮，右手的手套却带着轻薄的护甲，中间有块宝石，散发出庞大的力量波动。
完全变成美少女的上条出现在了众人面前。
「虽然我之前有猜过了，但还真会这……」
说到一半的黑长直美少女连忙捂嘴嘴巴。因为她发觉，她刚刚说话的口吻完全是女孩子的语气。
和上条契约的龙王把关于她这个魔法少女的知识发送到了她的脑海里。
首先是战斗用的知识和自身能力的知识。作为魔法少女的上条，主要武器是右手的手套「幻想杀手」，拥有强大防御力和攻击力的同时能够破坏异能之力。
和本篇的版本不同，这个手套的能力是要主动发动的。如果上条需要，她也可以像别的魔法少女学习和使用通用的魔法。
其次是关于上条变身状态的说明。龙王告诉她，变成女性是仅限变身期间，解除变身就会回到男性姿态。此外，在变身期间，变身状态的buff会让她的言行自动变得女性化，并且自动适应变身后的身体（不然可能会出现身体控制不协调的问题），算是给魔法少女通用的「避免被发现真实身份」buff追加上来的效果。
总之先不管那么多，新生的魔法少女向眼前邪恶组织发起了进攻。
她的战斗方式是以拳头为主，而变身极大强化了她的身体能力，让上条一拳就能打败一头巨型魔兽。在她那凶猛的拳头下，这个邪恶组织很快就被击溃了。
于是，上条当麻就这样成为了一名魔法少女。
而蜜蚁爱愉则是出于对上条的崇拜，成为了在他背后帮忙的支援者。
*
成为魔法少女后，上条需要取一个魔法少女名，他想了一些时间，最后决定叫「诗夜」，也就是魔法少女诗夜。
在那之后，魔法少女诗夜不断的活跃着。
上条的团队也增加了其他人。
首先是食蜂操祈（普通人），她被上条从那些被魔兽操纵、使用恶魔机车的少年们手上拯救，加入了上条的后援，并开始了和蜜蚁日常的互相妨碍生活。
然后是白井黑子（魔法少女），能力是空间移动的魔法少女，在12岁时被诗夜所救，迷上了上条。虽然不管上条哪个性别都喜欢，但还是最喜欢魔法少女形态的上条（魔法少女诗夜）。加入后和蜜蚁、食蜂日常竞争，而上条完全不知道此事。
茵蒂克丝（魔法少女），同样身为魔法少女的她得到了上条的帮助，然后就成为了上条团队的第二个魔法少女。
姬神秋沙（普通人），不是魔法少女却有特殊能力，吸血系魔兽和吸血系怪人的克星，一直憧憬着魔法少女，并希望成为魔法少女。
御坂美琴（魔法少女），自称最强魔法少女，不允许有比自己更强的魔法少女存在。团体吃瘪担当1号。
神裂火织（魔法少女），茵蒂克丝以前的搭档，曾经出现过隔阂，在上条的帮助下得以解除。战力很强，却是团队的吃瘪担当2号。
风斩冰华（魔法少女），人造魔法少女，因为恰好和茵蒂克丝成为朋友，在直面了自己的身世后加入了上条的团队。
还有五和（魔法少女）、芭德薇（魔法少女）等等……
以魔法少女诗夜为首，这些魔法少女们打败了一个又一个的邪恶组织、魔王等威胁，甚至在右方之火的手上拯救过世界。
顺带一提，随着上条从初中升到了高中，他发觉自己在诗夜形态下的身体也在逐渐成长，变成了一个大美人。
而屡屡出现在人们面前，甚至打败了右方之火的魔法少女诗夜，人气可谓是世界第一的魔法少女，很多男性（甚至女性）把她当成梦中情人，并且还有人画了诗夜的本、做了抱枕之类的……这让上条知道的时候很是尴尬，特别是食蜂、蜜蚁、黑子这几个还买了一大堆。
然而，在某一天，一个名叫「格雷姆林」的邪恶组织横空出世。这个组织打败了很多个魔法少女，甚至将不少魔法少女捕捉并恶堕。
魔法少女们与「格雷姆林」相对抗。
但在打到「格雷姆林」的首领，魔神奥丁时，却迎来了惨败。
魔神奥丁是一个金发的英俊少年，因为好好的穿裤子（虽然上衣仍然不正常），他的暴露度比同位体的奥帝努斯小了很多。
奥丁把诗夜她们关了起来，并且试图强行对诗夜下手。他明知道诗夜的真身，却故意用封印魔法禁止她解除变身，保持魔法少女的形态。
「如果你反抗，我就会杀死你的同伴，一次杀一个。」
奥丁一把搂住诗夜的腰，一边在她耳边轻声说道。
绝望、不甘、愤怒，然后是毅然的眼神出现在诗夜美丽的眼睛中。
奥丁非常欣赏这一幕，并开始了更进一步的事情。
他想要试试看，这个魔法少女能够撑多久才会在自己手上恶堕。