女性HPV感染可以通过药物治疗、物理治疗、手术治疗、一般治疗进行治疗。HPV是人乳头瘤病毒，属于病毒感染，临床上高危型HPV感染与宫颈癌的发生相关。
1、药物治疗：对于阴道镜检查、醋酸试验及宫颈组织活检后无异常的女性，可在医生指导下应用维A酸乳膏、重组人干扰素α2a栓进行治疗，也可使用氟尿嘧啶乳膏进行治疗;
2、物理治疗：对于阴道镜检查、醋酸试验以及宫颈组织活检后确定癌变风险较高的女性，可采取二氧化碳激光治疗、高频电刀治疗、微波治疗、液氮冷冻治疗等物理治疗的方式清除病变组织;
3、手术治疗：若女性宫颈细胞学检查和阴道镜检查结果均为阳性，应采取宫颈锥切术或消融治疗。若女性宫颈细胞学检查结果为阴性，但高危型HPV持续感染，或者宫颈组织已经发生癌变，可采取宫颈锥切术进行治疗;
4、一般治疗：女性HPV感染者应注意合理膳食，加强营养，多进食鸡蛋、牛奶、瘦肉等高蛋白食物，以及新鲜的水果蔬菜，如苹果、芹菜等。在治疗期间应避免进行性生活，注意会阴部的清洁卫生，定时清洗会阴部，预防感染加重。
除上述治疗外，女性HPV感染治疗后应定期复查，可进行宫颈癌筛查等相关检查，观察疾病的恢复情况以及预防复发。