选好了药物，用药方法也很重要。
1. 一般建议连续服用10天或14天，倾向于14天疗法，中间不要随意停药。擅自少服、停药，不但可能降低根除率，还容易诱导产生耐药菌株。
2. 抑酸剂和铋剂需要在饭前0.5~1小时服用，两种抗生素需要在饭后0.5~1小时服用，以减少胃肠道不适。
3. 抗生素需要达到一定的剂量方可产生疗效，这与说明书提示的剂量及频次可能有一定区别，因此患者应在医生指导下服用。
幽门螺杆菌在四联治期间的九大禁忌
1、不能喝牛奶、酸奶、其它乳化食品，原因是会让铋剂失效，不能保护胃粘膜。
2、甜味的水果、醋等都不能吃，也不能吃甜食，包括蛋糕、糖等。由于这些都会刺激胃酸分泌，那种抗生素在胃太酸的环境下不能起作用，就等于白喝了。
3、最好不要吸烟，否则会使脱除率降低。
4、不能喝酒，因为有的四联药里面都有头孢，同时服用有生命危险。
5、不能吃油腻的食物，比如说火锅烤肉，因为这个过程就是杀死病菌的过程，所以胃的褶皱里不能有乳化油腻。
6、一旦开始服用药物，一定要坚持服用，坚持两周左右。
7、如果被打断了，幽门螺杆菌这次不能治疗好，幽门螺杆菌就会产生抗药性，再吃任何药物都很难治愈。
8、家庭朋友一起治疗。经常接触的人，同时感染的可能性比较大，推荐同时治疗，避免二次感染复发。
9、就餐实行分餐制，使用公筷，碗筷餐具高温消毒。