西医学是建立在人体解剖学基础之上的医学，它的研究思想及方法依然离不开现代物理学的范围。
从这种理论和方法出发，西医将人看成一个纯物质的东西，就像一架工业社会的机器一样，心脏损坏了可以换一个人造心脏；阑尾发炎了，可以割掉；对待一个肿瘤，既可以用手术刀切除，也可以用放射线杀死。这种方法与对待一辆破旧自行车、一架破机床几乎没有两样，自行车的链条断了，可以接上一节，机床的电机坏了，可以换一个新电机。
说白了，这就是西医，真够理性思维的，按照方舟子的说法，这是科学的。
那么按照方舟子的言论什么是科学呢？
科学就是我理解的就是科学，我不理解的就是伪科学。
比方说：哥白尼发明了日心说，人们不理解，于是将他烧死了。
就好像秦始皇墓出土的铁剑不锈，现在的科学解释不了，怎么办？于是这把铁剑被科学界和谐掉了。
就好像，古代人不能理解社交网络。
就好像，在解剖学中，根本找不到经络穴位，于是就睁着眼睛说它不存在。
他是不存在，还是我们真的找到了发现它的方法？
中医一个伟大的发明，在西医产生之前就在中国土壤上行之有效的存在了几千年。
在西医还不存在的时候，中医就能治疗现在八成的疾病。
人们看不懂周易，就说周易是迷信。
方舟子看不懂中医，就说中医是假的。