正常情况下结膜囊内可存有细菌，大约90%的人结膜囊内可分离出细菌，其中35%的人更可分理处一种以上的细菌，这些正常菌群主要是表皮葡萄球菌（>60%），类白喉杆菌（>35%）和厌氧痤疮丙酸杆菌，这些细菌可通过释放抗生素物质和代谢产物，减少其他致病菌的侵袭。当致病菌的侵害强于宿主的防御机制或宿主的防御机能收到破坏的情况下，如干眼、长期使用糖皮质激素等，即可发生感染。患者眼部有结膜炎症和脓性渗出物时，应怀疑细菌性结膜炎（bacterial conjunctivitis）。
按发病快慢可分为超急性（24小时内）、急性或亚急性（几小时至几天）、慢性（数天至数周）。按病人的严重情况可分为轻、中、重度。急性结膜炎患者均有不同程度的结膜充血和结膜脓性、黏液性或黏液脓性分泌物。急性结膜炎患者通常有自限性，病程在2周左右，局部有效治疗可以减轻炎症程度和缩短疾病持续时间，给予敏感抗生素治疗后，在几天内痊愈。慢性结膜炎无自限性，治疗较棘手。
临床表现：急性**状结膜炎伴有卡他性或黏液脓性渗出物是多数细菌性结膜炎的特征性表现。最初单眼发病，通过手接触传播后波及双眼。患者眼部刺激感和充血，早晨醒来睑缘有分泌物，起初分泌物呈较稀的浆液性，随病情进展变成黏液性及脓性。偶有眼睑水肿，视力一般不受影响，角膜受累后形成斑点状上皮混浊可引起视力下降。细菌性结膜炎**增和和滤泡形成的严重程度取决于细菌毒力包括侵袭力。白喉杆菌和溶血性链球菌可引起睑结膜面膜或伪膜形成。