查克图恩遗迹是由斯洛文尼亚科学与艺术学院副教授伊凡-斯伯拉克领导的一支研究小组发现的。考察过程中，他们发现了15座金字塔——其中一座的高度达到75英尺（约合22米）——球场、广场以及带有雕刻图案的石柱。“Chactun”这个名字意为“红岩”或者“巨岩”。

斯伯拉克表示查克图恩的人口不及危地马拉的大型玛雅城市蒂卡尔，人口可能达到3万或者4万。他们需要进行进一步研究，以得出更准确的估计。查克图恩可能在玛雅文明的古典时期晚期走向全盛，也就是公元600年到900年。

斯伯拉克研究获得墨西哥国家人类学与历史研究所的批准，经费由美国国家地理学会和两家欧洲公司提供。他指出查克图恩是在尤卡坦半岛中部低地上演的最大发现之一。这座玛雅古城面积22公顷，距离切图马尔西部约120公里。距查克图恩最近的城镇是希普吉尔，相距大约25公里。

斯伯拉克表示：“这里完全被丛林覆盖。”虽然查克图恩一直不为学术界所知，但斯伯拉克发现了能够证明二三十年前这里曾有人来过的证据。自此，查克图恩一直无人问津，直到斯伯拉克等人的到来。

他说：“伐木工人和树胶采集者一定来过这里，因为我们在树上看到了切口。不过，他们从未告诉其他人。”

斯伯拉克和他的研究小组对15年前拍摄的航拍照进行了分析，最后发现了这座废墟并标注出坐标。这些照片是墨西哥国家生物多样性知识与利用委员会拍摄的，用于对这个自然保护区进行监控。

在此之后，他们用了3周时间在丛林里开辟出一条10英里（约合16公里）的道路，最后进入查克图恩遗址。在进行了6周的测绘和拍摄遗迹之后，他们封堵了这条道路而后离开，防止他人进入，破坏这个遗址。

斯伯拉克表示他们在查克图恩发现了多个球场，说明它是一座非常重要的城市。查克图恩可能在大约1000年前废弃，原因可能是人口压力、气候变化、战争和叛乱。斯伯拉克希望这一发现有助于了解这一时期的玛雅帝国不同地区之间的关系。

玛雅文明是哥伦布发现美洲大陆之前最先进的文明之一，鼎盛时期统治着包括尤卡坦半岛、伯利兹、危地马拉和洪都拉斯在内的广阔地区。

繁荣时期，这座玛雅城市的人口达到9万。2012年12月，数千人前往尤卡坦半岛，庆祝玛雅年历一个新周期的开始。在庆祝的同时，他们也带着一份恐惧，因为他们相信玛雅人的末日预言。根据玛雅人的预测，2012年12月21日，地球将走向毁灭