一。怎样辨别基质灭菌是否彻底：基质经灭菌冷却接入目标菌种(本吧为北虫草)后，若表面发生了零星的目标菌或少量霉菌菌落，再培养一段时间目标菌和霉菌菌落死亡，基质变稀烂发臭，可确定为基质灭菌不彻底。灭菌不彻底的基质中存在多种微生物，其中细菌繁衍速度最快，其次生产物及其分泌物对异类具有极强的杀灭作用，因此其它种类不能够在灭菌不彻底的基质中生存。若基质中的目标菌和霉菌等真菌能够继续生长，为基质灭菌后，于凉料、接种操作等环节出现失误造成的次生污染，与灭菌无关，因为霉菌等真菌(除寄生除外)与目标为营养竞争关系，仅为损失基质营养，并无毁灭性的杀灭现象存在。
二。怎样确定基质合适的水料比：目前制备基质的原料基本为大米和小麦2种，一般大米的料水比为1：1.2，小麦为1：1.3较合适。经灭菌后若颗之间有糊状物或适量接种后其表面已经长满菌丝体，但中、下部及底部无菌丝，则表明水的比例大了。另外，不同品种及品质的大米，由于淀粉的溶解率不同，其水料比应作适当调整，粘度高的应比粘度底的减少加水量。总之，适当的料水比制备的基质颗粒间有小缝隙，通透性好，菌种液于基中分布均匀，有利于发菌。