战争正式开始。樱迷宫化为战场，BB突破Moon Cell防壁的速度显著下降，而她黑化的速度也显著的下降。对现状不满的Melt Lilith决定独立，却被Violet为首的其余alter ego镇压。Kazura Drop和Passion Lip拦住了要杀Melt Lilith的BB和Violet。Kazura Drop言道，BB自己杀死alter ego，无异于焚心。Melt Lilith若死，BB的人格也将产生剧变。BB也终于开始正视自己的alter ego能为自己带来怎样的变化。
格洛丽亚遭到了人格终于失控的露丝的暗杀。格洛丽亚奋起反击之下，将露丝打到濒死状态，并将之封印成她的座舰的船首像。王小龙确认了格洛丽亚的精神状态之后，决定暂时离开。格洛丽亚与白野的联军势如破竹。白野击败了第五部分的卫士伊丽莎白之后，见到了还根本没来得及开拓第六层——也就是本该由Melt Lilith把守的迷宫——的BB。BB此刻也正为MC中枢最后最强的防壁，理论404光年防壁（具体名字记不得了）而头痛。格洛丽亚向BB索要除了她身为高等级AI之外的所有计算资源，并声言“白野以及其他所有人的命运由我来拯救”。BB也知道格洛丽亚手里现在真正掌握了一个仅计算能力可以达到一小部分MC中枢能力的灵子计算机，但却不甘心自己不能拯救在她眼里注定失败的白野。两人在理论404光年防壁前决一死战，两败俱伤。白野赶到，暂时劝住了BB。三方最终开始共同攻陷最终防壁。
防壁陷落，BB却使出前所未有的杀招——将全部的alter ego留下，组成了“群像·百合花墙”这样恐怖的墙壁。格洛丽亚意识到BB如此行事的后果，禁不住大骂愚不可及。便在此时，杀生院突然带着汉尼拔等人施施然的降临，自己进入百合花墙将五个alter ego全部据为己有。随即，杀生院也进入Moon Cell中枢，准备按照原计划夺取BB以及整个中枢的控制权，再使用安徒生的宝具化身为天魔。
不想在融合进行到最后阶段，安徒生被BB早已安排好的最终伏笔——弑君者偷袭重伤，而弑君者随后又被早有准备的汉尼拔杀死。空有计算资源而未能转生的杀生院，也被汉尼拔与格洛丽亚联手击败（诸葛亮与西庇阿为启动汉尼拔的神话礼装便当）。原来当时汉尼拔与杀生院祈荒接触之后，便慢慢揣测出了杀生院的计划，于是决定反过来利用之。最终，重伤之下的格洛丽亚与同样重伤的汉尼拔再次战斗。汉尼拔险胜格洛丽亚，却无论如何都无法将其杀死。格洛丽亚冒着人格崩坏的危险，理解并使用了原本只有Moon Cell才有权的事实选择能力，强行将此次战斗的结果锁定为“不败”。汉尼拔虽不甘心，也只得承认战斗为平手。

阿提拉如同一匹孤狼一般，开始组建以破坏moon cell为任务的军团。而就在此时，尼禄不知道的第四个在圣杯战争中胜利的白野和吉尔伽美什火线回归。白野在吉尔伽美什的建言或者说命令下，与阿提拉联手。白野自己的念头也非常单纯：将阿提拉从游星赋予的使命下解脱出来。而为此，她需要完整的王权戒指。破坏军团顺利结成。除了原作的伊斯坎达尔和贞德，还包括了弑君者以及参孙。
擎天柱、新罗马帝国以及阿提拉率领的破坏军团，自此展开了围绕王权戒指的战争。在三方之中，只有格洛丽亚坚持讲此战称为第二次圣杯战争。原因在于Moon Cell归档之后，除了格洛丽亚以及可能还在月球内侧的BB，无人知道曾经在Moon Cell中枢曾经发生过什么。
格洛丽亚作为其他平行世界可以说几乎不该存在的异军突起的势力，自然受到了阿基米德以及其背后的游星势力的关注。在阿基米德看来，如果格洛丽亚代表的地球与moon cell同归于尽，这当然是最好的选择。阿基米德于是开始协助格洛丽亚夺取王权戒指碎片，当然名义上是要扶持素质上显然更优秀的格洛丽亚成为Moon Cell的王。格洛丽亚决定坐镇旗舰“Neo Atlas”，派出汉尼拔使用其最擅长的奇袭战术——首先打击阿提拉的破坏军团。在格洛丽亚看来，新罗马帝国实际上已经坐拥四分之三的王权戒指且人多势众，自然威胁较大。
汉尼拔带着恩奇都和威廉退尔绕过了破坏军团与尼禄交战的大片战场，双方在未明领域发生激战。吉尔伽美什与恩奇都战的天昏地暗，汉尼拔苦苦支撑，与威廉退尔一起拖住伊斯坎达尔和贞德。阿提拉随即忍无可忍进入战场，汉尼拔的战术最终没有成功。然而也就是在这片激战之中，吉尔伽美什把一份神秘的数据交给了恩奇都。
这份数据，实际上是吉尔伽美什与白野在那遥远的黄金之都中寻得的有关游星及其尖兵的记载。吉尔伽美什与白野所见的黄金之都，是活过了游星袭击的一个类似Moon Cell的灵子计算机构筑的世界，而这份数据之中很可能包含着存活的关键。而且看吉尔伽美什的样子，他必然是心里有数的。格洛丽亚从恩奇都手里拿到数据，当即宣布闭关不出，并命令汉尼拔继续袭扰一切可以袭扰的势力，但是不要把对方惹急。

其一：使用圣杯降灵仪式召唤战力完整的冠位七骑，或者启动与这7人战力相当的一定数量英灵的神话礼装。但是显而易见的这需要很多计算资源，一个moon cell也不一定够用。加之格洛丽亚和Moon Cell的观测都已证实，目前的冠位七骑，有两个空缺。而且，就算战胜了阿提拉以及其本体，之后的游星主体也是绝对战不下的。正面战斗显然是不可取的。（这个选择通向外传《Fate Grand Order：特异点·天外永劫战场人理定础值FEXTAS》）
其二：一个Moon Cell不够，那么就需要更多。格洛丽亚提出了阿特拉斯学院早有的一个计划。把地球上的所有人类的肉体炼化为贤者之石组成难解/格洛丽亚的一部分，使之成为计算能力和资源数量匹敌Moon Cell的真正灵子计算机（也就是欧西里斯之沙了）。人类的灵魂和精神则全员灵子骇客化。如此一来，人类就会脱离日渐死亡的地球，同时实现真正的进化。之后要与游星战斗，或者更好的，逃亡，也是一种选择。（通向结局：人类补完计划）
格洛丽亚正要说出第三种选择的时候，潜伏在暗处的阿基米德偷袭阿提拉——但是他实际的目标却是吉尔伽美什。然而这一刀却没能切实的落在阿提拉身上，中招的是吉尔伽美什。原来“这一次的”阿基米德早已知晓，吉尔伽美什的父亲与阿提拉有约，无论如何需要帮助阿提拉一次。而这一次帮助的代价颇为惨烈。之前经过剧烈战斗的吉尔伽美什被蓄谋已久的一击直接打成濒死。千钧一发之际，格洛丽亚喝令白野使用令咒执行了这样的命令：将白野与吉尔伽美什的主从关系废弃至圣杯战争之前的状态。这一手可以说是效法了只有格洛丽亚知道的CCC里面雷欧的做法。吉尔伽美什一脸愕然，虽然保住一命，却被因果律直接传送离场。而吉尔伽美什的白野的存在也变得岌岌可危——因为没有吉尔伽美什，她在FE第五战结束后就会因为没有servant被抹杀。

也就是此时，格洛丽亚调用了难解目前能调用的最大数量的计算资源，做出了第三种选择：使阿提拉真正成为白野的servant，把阿提拉本体也就是巨神不具备的身为人的要素赋予她，然后让巨神本体反水，是为以毒攻毒（这个计划的出处是格洛丽亚观测到的原作真结局）。阿提拉成为了FE圣杯战争的白野servant，来修正这一个白野系将遭遇的因果悖论。存活下来的白野，精神也受到了这条硬生生出现的世界线的冲击。现在，与她度过那残酷的淘汰赛的servant不再是那个berserker也不再是后来的吉尔伽美什，而是阿提拉了。而虚弱状态的阿提拉也接受了这些记忆。
阿基米德老羞成怒，决定启动巨神的座舱，强行觉醒巨神来破坏Moon Cell中枢。撕裂了世界的格洛丽亚和难解也陷入了虚弱状态，濒临毁灭。四个白野当机立断，统合王权戒指，调用Moon Cell暂时维持住格洛丽亚的灵魂状态。阿提拉回归巨神本体，解放了军神之剑的真正力量。但是没有王权之戒，Moon Cell无暇分神，如何对抗游星的碎片也成了问题。也就是此时，月球里侧的通道打开了。格洛丽亚以为生死不明的BB打开了月球里侧的通道，带着“没有遇见过白野的”吉尔伽美什从天而降。吉尔伽美什本来对于要去拯救一个不知所谓的**这件事颇为抵触，但是实际上了解状况之后，吉尔伽美什如同白野想象的一般，选择了战斗。
一旁，处在崩坏边缘的格洛丽亚的意识通过王权戒指再度连接Moon Cell中枢。她也明白了为何当初Moon Cell没有阻止她从中枢逃离。作为一个无感情的计算机，Moon Cell做出了这种把希望赌在白野和格洛丽亚身上来对抗游星的选择，实属不可思议。格洛丽亚的精神暂时依附在王权戒指之中。阿提拉的白野在格洛丽亚的指示下，把戒指套在了阿提拉的手指上。

结局毫无悬念，在游星尖兵（大王）+王权戒指+格洛丽亚/难解远程支持的三重加成之下，游星碎片的11次元防壁根本不堪一击，而这条世界线也无事迎来了完美的大结局（尼禄以及白野一号留下；玉藻前在白野二号的说服下放弃了统治Moon Cell的想法，但是回到本来的平行世界就被自己的其余8个分身糊一脸；红A和白野三号受到吉尔伽美什启发，决定浪迹天涯顺便调查游星其余尖兵的动向；大王和白野四号过上了一天有时两次有时三次的生活）——除了吉尔伽美什以外。
太阳系的游星碎片当然不可能只有大王一人。精神污染专长的第二号游星碎片，即将醒来。而长久封印于黑暗的充满人类恶性情报的月球里侧的吉尔伽美什，是最有可能出事的。BB离开月球里侧，与之同行的还有她的alter ego一众人等。BB决心在游星第二号尖兵到来之前，保护好地表的白野，以及保住与白野有缘的吉尔伽美什。
回到地球的格洛丽亚，则接受了意料之外的人的请求。这个人正是CCC线和樱喜结连理的白野。白野和这一个樱连入难解的网络，她在新世界的战斗，也还未完结。
（FEXTAS就此完结）

我发现我和官方的撞车概率有点高。FGO第二部，福尔摩斯和达芬奇做了个虚数潜水舰，我这个小说里也有一个类似的东西，只不过功能没那么夸张。而且这个虚数潜水艇的核心部件是阿特拉斯的“纸月亮”，我写的潜艇也可以算是阿特拉斯院作品……