宇智波的覆灭
宇智波一族虽被木叶委以重任，但全族却越来越远离权利核心。族内对木叶高层颇为不满，时任族长的宇智波富岳计划政变，篡夺火影大位。宇智波止水本想以别天神阻止这场战争，不料团藏并不信任他，反而把止水的右眼摘走。止水为防最后一只左眼再落入团藏之手，将左眼送给鼬，嘱托鼬一定要阻止这场叛乱，之后止水投南贺河自尽。宇智波富岳长期令暗部分队长宇智波鼬为间谍深入木叶高层，打探机密。鼬亦不忍村内忍者互相残杀，将宇智波政变计划透给木叶高层。三代火影猿飞日斩希望通过谈判和宇智波达成和解，而时任暗部长官的志村团藏却有意剿灭宇智波一族，团藏以佐助相要挟。最终鼬决定配合斑（实为宇智波带土）歼灭全族，但要求团藏放过佐助。灭族之后，鼬以间谍身份加入晓组织，继续为木叶打探情报守护木叶。而在灭族过程中，志村团藏、宇智波带土分别收集了大量写轮眼。这也为后来团藏、带土使用伊邪那岐创造了条件