1. 摇床培养的细菌是在进行有氧呼吸吗？不是。 只有在早期才进行有氧呼吸。用氧电极测定，OD600超过0.2~0.3时候，培养基内就完全没有氧气了。此后一直到平台期前，都处于微厌氧状态。平台期时候，细胞才回到有氧呼吸状态。有关文献，例如 Svetlana Alexeeva et al., 2001, J. Bacteriol. 184:1402
2. 离心收集菌体靠谱吗？
大部分情况下不靠谱。 在离心的时候，细菌受到：重力加速度胁迫，氧胁迫，营养胁迫，低温应激（如果4度离心），并且细胞表面附着性质发生巨大改变。在几十秒钟内，相应sigma因子被表达，大量应激通路打开。如果不在离心前处理一下细菌，基本任何细胞内定量结果都是会被质疑的。
3. 细菌接合时，DNA是从连接两个细菌的菌毛中转移的吗？
不是的。可惜的是，至今大多数微生物教材还是这么写的。实际上菌毛作用只是固定以及拉近两个细菌。DNA通过一个复杂分泌系统转移。关于这个问题，有一篇经典的综述http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC372970/。近期的综述有http://www.sciencemag.org/content/310/5753/1456.abstract。 20年过去了，这个谣言依旧在大多数中国以及一部分美国微生物教科书上教给一代代人。
4. 接菌的时候，用火烧烧瓶或者试管的口，有防止污染的作用吗？
根据一篇1972年的文献 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC380367/，火烧或者不烧，污染就在那里，不多不少。想要减少污染，只有8个字：出手要快，瓶口要斜。
5. 细菌没有核膜吗？
有的有，比如浮霉菌门 ，有和核膜非常类似的膜结构包裹DNA
转载翻译自microbewiki