稍晚于王韬，清末出现了两部重要的长篇剑侠小说：唐芸洲《七剑十三侠》和张小山《平金川全传》。
唐芸洲《七剑十三侠》是清代剑侠小说的高峰，包涵了飞剑传书、剑气如虹、兵解成道等诸多重要构思，对民国剑侠小说产生很大的影响。只是对于飞剑的设定，仍然是基于从唐到明相袭的剑丸吞吐。而之前的王韬和与其同时的张小山《平金川全传》，飞剑都已有意无意地摆脱这一陈旧模式了。

"飞剑传书"
唐芸洲：《七剑十三侠》
61回
玄贞子当下写好一信，望空投去，口中吐出白光，一同飞卷而上，倏忽不见。片时白光飞回，玄贞子接在手中，化为一剑，上插回信数封。递把众人观看，知是凌云生、御风生、云阳生、独孤生、卧云生、罗浮生、一瓢生、梦觉生、漱石生、自全生都在海外，回信说不日就来；飞云子却在湖北，转眼就到。此正是仙家妙法，名为飞剑投书，比电报简捷多了。因为玄贞子是第一剑仙，预知未来，凡道友现在何方，都能晓得，书信投去，即得回音，若是剑术差些的便不能了。
133回
徐庆道：“末将等的诸位师父，皆能飞剑传书，故此寻到一位，便请那一位用飞剑传书，各处去请。所以只须寻到一位，便可大家会齐的。”

"行气如虹"
唐芸洲：《七剑十三侠》
(似为孤例)
142回
一路行来，真是他们会剑法的人，毫不费事。只见行神如空，行气如虹，不到一日，又回至大营，仍从空中落下。

"兵解成仙"
唐芸洲：《七剑十三侠》
62回
道怎的兵解成仙？仙家有一派流传，要度脱凡人成仙，必要此人死于刀兵，可脱凡胎，这就名为兵解，并非是旁门左道，不过是个外功，与玄贞子内功一道，略有分别。内功是凡胎肉骨亦可飞升，外功必须脱了凡胎方能成道，两者虽有内外之分，并无高低之别。

从唐传奇开始，剑侠或锄奸杀贼，或降怪斩妖，乃至敌方亦属剑侠，对于飞剑或剑术本身，并无正邪之分。这个问题在《七剑十三侠》中，开始有了道德倾向，正邪有别，高下易判。
唐芸洲：《七剑十三侠》
144回
徐鸿儒此时也正要捉拿包行恭回寨，忽见半空中落下一个道士来拦住他去路，不觉大惊，也大喝道：“你是何人，敢来挡本真人的去路？可快通名来，好让本真人取你狗命！”一尘子喝道：“本师的大名不便与你知道。妖道体得猖狂，看本师的剑罢！”说着口一张，只见一道白光从口中吐出，登时一口剑盘旋飞舞，向徐鸿儒头上砍来。徐鸿儒一见，知道是七子十三生中的人物，正欲取剑来架，却好童子将剑呈上，徐鸿儒急急取过，向空中一抛，喝声道：“疾！”只见两口剑就在空中叮叮——斗将起来，好似两条怒龙在半空中角力：一个是炼就空中之气，费许多丹药而成；一个是全凭化外之邪，竟仗此锋芒抵敌。两口剑斗了有半个时辰，彼此不分胜负。

张小山《平金川全传》对于剑侠小说元素的贡献，则是飞剑采炼的原料以及剑光颜色打破了白光的单一主宰的局面。

张小山：《平金川全传》
6回
(云谷子)一见他五个道：“剑是火合宝石炼成的，能灭人间五金的毒气。你拿这剑杀上插白旗的碉楼上，就可破他了。”又将一把白色的剑付与明月子道：“这是采五金的精华炼成的，能灭草木的毒气，你将这剑杀上插青旗的碉楼上，就可破他了。”又将一把青色的剑付与清风子道：“这是王母园中桃木炼成的，能灭泥土的毒气，你将这剑杀上插黄旗的碉楼上，便可破他了。”又将一把黄色的剑付与赛癞残道：“这是汉朝隗嚣封函谷关的泥丸炼成的，能灭一切水毒，你将这剑杀上插黑旗的碉楼上，便破他了。”又将一把黑色的剑付与赛佛印道：“这剑是龙王宫内水晶淬炼成的，能灭一切火毒，你将这剑杀上插红旗的碉楼上，便可破他了。每位带精兵二千，破了他乘势把碉楼拆了，免致遗患。南先生另带五千兵去排阵。”

《平金川全传》也较早地系统阐释了修行之人转世不昧灵根的思想，当然在小说中是以藏传佛教活佛转世来立论推广的。其中二人前生为仇、今生莫名执着的"潜意识"，在蜀山中的朱文之于朱梅，金、石之于癫僧等皆有表现。
张小山：《平金川全传》
14回
(更生)便一直大脚步进去，拿起电气鞭，向葛尔丹一晃，早已魂归地府。……更生听见，仰面一望，知是师父无上祖师，便上来深深一揖，问：“师父如何来此？”无上祖师道：“快回去，你的仇已报了，何必多杀好人？”更生童子道：“弟子是为国家除害，不然与这葛尔丹何仇何恨？”无上祖师哈哈大笑，向他头上拍三下，更生一个寒噤，方知前因后果，也笑了一声，即刻随着无上祖师，回山修行去了。

附录：原文中"身剑合一"的一些细节
本传25回
(法元)主意决定之后，也不开门，便身剑合一，从后窗隙穿出，起在空中，挑那房屋高的所在，飞身进去。
67回
那人道：“这洞外面虽小，里面却大。被郭真人用神力搬了一块几千斤重的大石堵死，只留一个三寸大小的洞，准备早晚送饭与那小姑娘吃。等那小姑娘应允同郭真人成亲，只消她在洞中一喊，我们便去送信，郭真人便亲来放她。……”
急得郭云璞直跳脚道：“我上了这人的当了！我用法术移来这块大石，还有符咒镇压，重如泰山，任你天生神力也无法移动。我不该给那小贱人留下送饭的小洞，被救她的人(即佟元奇)运用剑光进去。救她的人知我法术厉害，那女子不会剑术，不能似他身剑合一，趁我移石的当儿，带那女子逃走了。”

222回
金蝉首将身剑合一，化成一道光华，向峰腰一个较大的孔穴穿出，欲待往里面捉它出来。……芝仙通灵变化，在灵峰还未飞走以前，便把内中门户机密探明，知所隐避，看似随意出入，实则生根藏伏之所，并无禁制。不过外人不似它身小通灵变化，决进不去，稍微走差，误入宝库左近，立被摄住，……平日常和芝仙打闹，觉着那是芝仙小手。心想：“身剑合一，如何敢于近身来打？”好生奇怪，念头略动，……猛觉着脚在实地，飞剑不知何往。