二者的区别比较大，最大的区别应该是非同一控制下的企业合并认可的是公允价值，而同一控制下的企业合并认可的是账面价值。
比如说非同一控制下的企业合并，其通过银行存款1000万元购买被投资单位80%的股权，被投资单位的可辨认净资产公允价值为1200万元。那么合并成本就是1000万元，合并商誉=1000-1200*80%=40万元。
而如果上述是同一控制下的企业合并，如果被投资单位的净资产的账面价值是1200万元，投资单位花费银行存款1000万元，那么初始投资成本=1200*80%=960万元，是不会产生新的商誉的，应确认的资本公积=1000-960=40万元。
这是二者最大的差别。
推荐于：2016-02-19