摄入异质(噬菌体M13)DNA在胃肠道中短暂存活,并进入小鼠的血液中
摘要:哺乳动物胃肠道(GI)的上皮细胞衬里是阻碍吸收外来DNA的一个紧密的屏障,还是这种外来的DNA可以渗透到有机体中??我们走近这个问题,通过吸管喂食小鼠圆形或线性化的双链噬菌体M13 DNA进行了研究,或者将M13 DNA添加到小鼠的食物中,这些老鼠的粪便分泌物以前被证明没有这种DNA。在不同的餐后时间,动物的粪便通过Southern或dot blot杂交或聚合酶链反应(PCR)检测m13 DNA序列。在Southern杂交中,m13 DNA片段的大部分在200~400 bp(碱基对)之间的尺寸范围内。在PCR分析中,合成的寡脱氧核糖核苷酸引物在M13 DNA分子上是有间隔的,这样可以确定持续M13 DNA片段的大小。我们也在喂食M13 DNA后的不同时间从全血中提取DNA,或从动物的血液细胞中提取DNA,并准备通过斑点杂交或PCR检测这些DNA的存在。M13 DNA片段被发现在1和7小时之间餐后的小鼠的粪便中。通过PCR分析,检测出712,976和1692个bp片段。在血液DNA中,PCR在喂食后2到6小时内发现了472bp的DNA片段。斑点杂交或Southern印迹杂交显示M13 DNA在2和4小时,但不在1、8或24小时后喂养。这个DNA被证明是脱氧核糖核酸酶敏感的。M13 DNA在血细胞和血清中均有发现,分析了由粪便或血液中PCR扩增的一段约400bp的DNA片段,并分析了其核苷酸序列,发现与真正的M13 DNA完全相同,除了几个偏差。M13 DNA在喂食前或在1小时之前,或在进食后7小时后,不能在粪便或动物血液中检测到。这些对照证实了结果的正确性,也证明了鼠的消化道被噬菌体M13所占领的可能性。此外,M13 DNA阳性细菌菌落从来没有从摄入M13 DNA的动物粪便中分离出来。重建的实验结果显示,在小鼠胃肠道中可以检测到2-4%的口服M13 DNA。从血液中提取的M13 DNA的比例大约在0.01%到0.1%之间。
介绍
在一些生物系统中,哺乳动物细胞可以吸收外来DNA并将其融入到他们的基因组中。在过去,我们研究了这种机制的某些方面,研究了腺病毒DNA与哺乳动物细胞基因组的整合(Doerfler 1968;Groneberg et al.1975;Doerfler et al. 1983;Jessberger et al . 1989;Orend et al . 1994;Tatzelt et al . 1993年)。在生物体内,由于部分或完全消化的营养成分的不断流动,胃肠道(胃肠道)会不断地暴露于外来DNA中。胃肠道上皮衬里的细胞表现出高翻转的原因有很多,可能不是所有的都是机械的。目前尚不清楚哺乳动物的DNA是否能存活,至少在一定程度上是,消化系统的酶系统,到胃肠道的细胞可以吸收外来的DNA,或者是来自营养物质的DNA片段是否能够从胃肠道进入血液循环。
在哺乳动物消化道中核酸的命运。《反刍动物》(McAllan 1980,1982;风暴et al. 1983)和老鼠(Maturin and Curtiss 1977),在几年前进行了首次调查。这些方法的灵敏度有限,无法排除微量完整的DNA片段在哺乳动物肠道中存活的可能性。
虽然现有的数据倾向于认为进入胃肠道的外DNA序列不能通过未经消化的,我们已经用目前的方法重新研究了这个问题。最严格的测试包括纯圆形或线性双链DNA的管理,直接或添加到食物颗粒中,在喂食后的不同时间对小鼠的粪便排泄。我们也从血液中提取DNA,从分离的血细胞和血清中提取DNA,并在喂食后的不同时间对其进行检测。
在本报告中,我们证明了1692bp长度的M13 DNA片段在小鼠胃肠道中存活了下来。M13mp18基因组含有7250个bp。在M13 DNA吸管喂养过程中,动物将异体DNA片段在1-7小时后排出体外。当M13 DNA被添加到食物颗粒时,在粪便中也会发现DNA片段。粪便分泌物中M13的DNA已被Southern和dot blot杂交识别,并通过聚合酶链反应(PCR)。在没有得到噬菌体DNA的对照组动物粪便排泄物中,从未检测到M13 DNA。我们还研究了从血液循环中提取的DNA,以获得M13 DNA的外观和持久性。在59种不同的动物的血液中检测到的M13 DNA片段长度为472 bp,在喂食后的2到6小时之间检测。
研究结果直接表明,哺乳动物摄入的外源DNA可以通过胃肠道系统存活,并能进入血液。
在小鼠粪便中检测到M13 DNA的过程
DNA印迹杂交分析的结果从小鼠粪便样本收集1-7小时后喂养,揭示了M13的DNA片段存在的长度< 200和1500 bp的之间(图1 a、b)。在喂食后24小时,M13 DNA不再被发现。共电泳标记DNA片段为碎片大小的估计提供了规模。很明显,在1和7小时之间喂养M13 DNA后,这个外来的DNA在粪便中排出。在一些实验中,M13mpl8 DNA之前用EcoRI的卵裂线将其线性化。分析结果与图1所示类似。
图1,电泳和印迹法分析小鼠粪便M13 DNA
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这些结果表明,未受保护的双链、圆形或线性M13 DNA直接给成年小鼠可以抵抗胃肠道的降解,在喂食后1-7小时的粪便中可以检测到,尽管是相当分散的形式。在50μg(图1)或10μg(未显示数据)M13 DNA被喂给小鼠时得到了类似的结果。在喂食之前,实验动物粪便中没有M13 DNA的痕迹。
扩增M13 mp18 DNA片段在粪便中的PCR
PCR方法在小鼠粪便中检测M13 DNA的应用,提供了一种方法来评估这种DNA在胃肠道中的存活。通过选择引物寡脱氧核糖核苷酸对P1和P2,在M13 DNA分子上分别定位712个核苷酸(图2C),确定了M13 DNA存活的餐后时间过程。图2a所示的数据显示,在喂食之前,小鼠胃肠道中没有微量M13 DNA。在喂养M13 DNA后1.5 小时到6 小时之间,可以检测到所选引物长度的片段(图2A)。用DNase提取的粪便提取物对DNA的处理消除了所有放大产物的痕迹。阳性反应的扩增产物也被杂交到真正的32P标记的M13 DNA,这是由Southern印迹杂交所显示的。
图2:M13mp18的DNA片段在粪便中的PCR
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我们下一个选择的引物位置更远(图2C),以评估M13 DNA片段最大长度的抗胃肠道降解,仍然可以从粪便中恢复。PCR分析结果显示,712 bp(引物对P1/P2),976 bp(引物对P1/P3,图2c图)和1692 bp(引物对P1/P4,图2C图)可以检测到(图2B)。
其他数据(未显示)表明,即使只吃了10 μg的M13mp18 DNA,M13的DNA信号也可以4-6小时后从粪便DNA中提取出来,并通过Southern杂交和PCR扩增。
点状杂交技术dot blot
我们也应用dot blot杂交技术检测小鼠粪便中M13 DNA。图3a中所示的结果表明,在进食后1-7小时,该方法可以很容易地检测到M13 DNA。无M13 DNA或在模拟喂养实验中未获得M13 DNA的小鼠的粪便中没有M13 DNA(图3 A,B),图3 A,B,两项独立实验的结果。
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我们还试图量化在粪便排泄中存活的口服DNA的比例。重组实验的结果表明,原本可以从粪便中提取的DNA的2-4%的顺序可以从粪便中提取出来(见图3A)。
在一些实验中,将M13 DNA的50μg添加到提供给小鼠的食物颗粒中。显然,在这种喂食机制下,无法确定摄入M13 DNA的确切时间。因此,我们在提供M13 DNA处理的食物颗粒后,记录了粪便收集的时间。通过使用dot blot杂交方法,可以在小鼠的粪便中检测到M13 DNA,在2、4.5、6、8小时的粪便中检测到M13的DNA,但不是颗粒暴露24小时(未显示数据。
我们得出的结论是,斑点杂交程序允许在小鼠的粪便中检测M13 DNA,直接用吸管喂食M13 DNA,或在食物颗粒中进行检测。粪便排泄是M13 DNA在1到7小时之间的阳性,在喂食后从1到4小时明显。在后期,M13 DNA就不能再被检测到。
从全血、血细胞或小鼠血清中恢复M13 DNA
到目前为止的结果的一个合乎逻辑的扩展是在小鼠的胃肠道外寻找M13 DNA。从血液中提取DNA,从血细胞中提取DNA,从动物血清中提取DNA。在一些实验中,30个μg或10个μg的M13 DNA被喂食,在没有接受噬菌体DNA的动物血液中,M13 DNA永远不能被斑点杂交或PCR检测到。在已经喂养了50 μg M13 DNA的动物中,197bp的M13 DNA片段(M13引物对P5/P6,见图2)可以在喂食后的2、4小时从全血DNA扩增(图4)。在DNA分离,收到了TE的动物,而不是M13 DNA,M13 DNA不可检测(图4)。在没有任何模板DNA扩增反应也为阴性(图4)。在实验中没有显示,M13 DNA片段的472bp可能放大DNA从全血中提取使用底物P5/P7。
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在进一步的实验中,我们通常使用斑点杂交(dot blot)法来演示M13 DNA在动物血液中的存在,这些动物的血液中有50、30或10 μg的M13 DNA。所有的DNA样本都是先用RNase进行分析,并将等量的总DNA(约4 μg)应用于斑点杂交杂交实验中使用的过滤器的每个位置。图5所示结果显示,喂食后2-4小时的小鼠血液(细胞和血清)中有M13 DNA。在一项实验中,M13 DNA在喂食1.5小时(未显示数据)后,在喂食小鼠的血液中3个DNA被发现。M13 DNA在没有M13 DNA喂食(图5)或M13 DNA喂食动物24小时后血液的DNA中无法检测到。在另一项实验中,M13 DNA在喂食(未显示数据)后,在8小时的血液中无法找到。印迹杂交信号消除之前的DNA样本DNase处理(图5),从血液中提取的M13 DNA也可以通过Southern杂交(未显示数据)来识别。
图5:
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通过对M13 DNA进行重建,以M13 DNA每槽1到20 ng的数量进行重组,以估计在喂食小鼠50 μg M13 DNA后,2小时和4小时之间的M13 DNA的含量。图5所示的结果表明,原本可以从1毫升血液中提取的50 μg DNA的一小部分大约0.01%到0.1%。这一估计是一个数量级的近似,因为只有一小部分动物的血液供应可以通过心脏穿刺来恢复。
从目前进行的实验来看,没有证据表明在3-6个月的范围内,动物的性别和年龄的差异影响了任何实验报告的结果(见表1,2)。
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表2:
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核苷酸序列测定证明M13 DNA可通过PCR从粪便或血液中获得
根据以前用M13 DNA(血液)或4小时(粪便)喂养的动物的粪便或血液对PCR产物的核苷酸序列进行了测定。在反应中使用引物P7(图2C)。在大约400个核苷酸中,序列被发现与其他地方发表的真实的M 13 DNA的核苷酸序列相同(yanisch - perron et al. 1985)。偶尔,在一些序列测定中,观察到一些核苷酸变化。然而,这些是随机分布在基因组上的重复的决定。因此,我们推测这些罕见的变异是由于PCR反应中的不忠。
M13 DNA降解在血液或粪便悬浮液中的时间过程
M13 DNA在37°C血液或粪便悬液降解,M13 DNA的持久性是紧随其后的是点状杂交后反萃取DNA后不同时期的孵化(图6)。在血液中,6小时降解消除所有M13 DNA。8小时后,MI3 DNA在粪便悬浮液中降解,约5%的噬菌体DNA仍可检测。在晚些时候(10小时),甚至没有痕迹的M13 DNA可能被发现。这些数据与活体动物得到M13 DNA的实验结果是一致的。