1997年2月7日，使用更高性能的NSX TYPE-S NA2推出，车架方面与NA1几乎一样，但搭载了改良自C30A的红顶C32B引擎，缸径被加大至93mm，使用非常高科技的纤维缸套，提高了压缩比，并延续了C30A的钛合金连杆，全新设计的曲轴及轴承；另外的如不锈钢排气管、双片式飞轮、全新的6前速手动波箱，16寸直径的前轮制动系统，电子转向助力机构等等，使之成为最大的改良版本。动力方面仍维持原来的280匹峰值马力于7300转时全数发放，扭力则是提高了1公斤并提早100转于5300转供给。97年的转款版NSX有3个市售型号：普通版的NSX；轻了30公斤的TYPE-S版（比原装版轻至45公斤的称为S-ZERO版）；和半开蓬版TYPE-T。99年，HONDA为对应更加严厉的环保条例，推出改良型C32B LEV引擎，使该国宝级的跑车得以继续生存，同时也对其6MT波箱作出修改，即具有双锥同步器的5、6档. 
 2001年12月，NSX再外形上作出了面世12年来的最大改动，最明显的就是取消了原有跳灯（Pop-up headlight）改为明灯，即俗称潜望镜的款式，她也算是最后一台改为此种形式的超级跑车了。2002年的5月更是令人着迷，除了外观上的改变外，早于1995年停产的NSX TYPE-R版本重新复活了，重量比TYPE-S版更低，只有1380公斤，悬挂、制动、行走系统均得到强化，加速时间更短，操控更直接。