自然门实验学校位于“全国文明城市”石狮市，创办于1988年,是市教育局直属九年一贯制学校。学校实行小班化模式，寄宿制管理，提供学生宿舍，每个宿舍拥有独立卫生间、淋浴室、空调等生活配置；学校配备标准实验室及各种功能室，每间教室配备教学一体机和空调满足学生音、体、美、信息技术等各类学科学习的需求；学校配有供学生一日三餐的标准化餐厅，小学配备专职生活老师,中学配备专职教官。
建校以来，学校先后与山东271教育集团、潍坊坊子实验小学、潍坊歌尔学校、济南舜耕中学等建立战略合作校，与福建师范大学、闽南师范大学、集美大学、武汉体育学院等全国优质教育资源进行对接。
学校教育教学质量持续提升，品牌知名度逐年提升，荣获“中国十大民办品牌学校”、“全国足球特色学校”、“福建省义务教育管理标准化学校”、“福建省体育传统特色项目学校”、“文明校园”等荣誉称号。