元朝末年，天灾人祸不断，汉人在蒙古有的欺压下积恨日深，在动乱的武林中，出现了二十四字真言：“武林至尊，宝刀屠龙，号令天下，莫敢不从，倚天不出，谁与争锋”。
话说张翠山夫妇与谢逊在荒岛上过了多时，这日殷素素生下了一个男，谢逊为其取名为无忌，十年后，张翠山夫妇与小无忌回到中原，而谢逊依然留在荒岛上。
张翠山夫妇回到中原，小无忌在半路被蒙面的官兵用玄阴掌打伤，在武当，张翠山夫妇被武林各派逼问谢逊的下落，夫妇俩不甘受辱先后自尽。
张三丰带小无忌上少林寺欲求易筋经为小无忌解毒，无奈少林并不开恩，张三丰只好带着小无忌郁郁下山，在山脚打退官兵救出已中截心掌的常遇春及女孩周芷若，为报恩常遇春与小无忌去蝴蝶谷找神医，而张三丰带周芷若回了武当。
在蝴蝶谷，神医胡青牛让无忌加入明教，否则见死不救，小无忌记着张三丰的教诲，坚决不从，胡青牛其后发现小无忌中的是疑难杂症，决定先医好后再把他弄死。小无忌得到《子午针灸经》后，发现可以用“烈火丹”与“镇风丸”制成截心掌的解药。用柴刀去后山砍下竹枝制成竹针，其后从胡青牛口中得到以“青蛇＋防风”可得镇风丸，从书房的书经中得到“大蒜＋鹿茸”得烈火丹，合成解药后救好了常遇春。
这天圣手伽蓝简捷等三人负伤入谷求医，胡青牛自然也是见死不救，不久小无忌发现受伤的峨嵋派的纪晓芙及其女儿杨不悔，为了救纪晓芙，再次向胡青牛求教，得到解药是“寒潭白鱼”，又去砍了支竹枝，与鱼钓合成“无饵鱼钓”，将其放入物品栏的手中，再在柴房右上角的角落得到蚯蚓，组成“有饵鱼钓”，去后山的水潭中钓得“寒潭白鱼”，治好了纪晓芙。简捷三人见小无忌年纪轻轻有如此大的医术修为，苦苦哀求小无忌为其救治，小无忌只好一试。在迷宫中找到“蜂蜜”与“断血散”，并得到了药王神康海的经书，在房前的树下挖出蜈蚣与红蝎，加上酒合成了“二仙化毒膏”，解救了三人的痛苦。但是三人的病情反复无常，小无忌很是奇怪，这天发现一黑衣人在水中下毒，却是胡青牛的情人师妹王难姑，两人斗气几十年，这次又互斗毒药而倒下，来找麻烦的金花婆婆见此安然而去，小无忌随后用“牛黄＋血竭”调成牛黄血竭丸，救起两人，两人让小无忌造个假坟以骗金花婆婆，赠与三颗九转苍龙与三支千年雪参后飘然而去。
小无忌造完假坟后骗过了金花婆婆，此时灭绝师太出现，弟子丁敏君不知天高地厚向金花婆婆无理，被金花婆婆打飞，灭绝师太与金花婆婆对决（动画）。金花婆婆不敌倚天神剑离开。此时灭绝师太要纪晓芙回杨逍身边伺机杀杨逍，纪晓芙宁死不从，死于灭绝师太掌下。小无忌赶快拉着杨无悔逃走。
两孩童在半路遇上了昆仑派的少女詹春奉命追杀苏习之，原因只不过是因为苏习之无意见看到何太冲练剑。苏詹两人同时负伤，小无忌为了救两人，来到城镇里找齐“何首乌”、“燕窝”、“五味子”与“紫河车”四样物品（虽然药店的老板不在家，不过可以从街上那货郎中处购得）。苏两人醒来后自是感激不尽，小无忌见两人上昆仑，于是一齐同行。
在昆仑山上，掌门何太冲因为小妾五姑身中怪病全身浮肿而气恼，这时詹春向掌门推荐小无忌，小无忌发现病由金银血蛇引起，为了捉蛇，小无忌以“断肠草＋青陀罗花”制成“驱虫水”，以“鸡蛋＋灵脂兰”制成“醉蛇丹”，捉住两条金银血蛇，救了五姑。何太冲为此感激而送小无忌下山时，却被冲出来的大夫人班淑娴拦截，原来蛇是她所放，何太冲是个老婆奴，只好打算杀掉小无忌，此时杨逍出现，救出两个小孩童。小无忌把杨不悔的身世告诉了杨逍，随后独自下山，却被追来的班淑娴打下了悬崖。
话说张翠山夫妇与谢逊在荒岛上过了多时，这日殷素素生下了一个男，谢逊为其取名为无忌，十年后，张翠山夫妇与小无忌回到中原，而谢逊依然留在荒岛上。
张翠山夫妇回到中原，小无忌在半路被蒙面的官兵用玄阴掌打伤，在武当，张翠山夫妇被武林各派逼问谢逊的下落，夫妇俩不甘受辱先后自尽。
张三丰带小无忌上少林寺欲求易筋经为小无忌解毒，无奈少林并不开恩，张三丰只好带着小无忌郁郁下山，在山脚打退官兵救出已中截心掌的常遇春及女孩周芷若，为报恩常遇春与小无忌去蝴蝶谷找神医，而张三丰带周芷若回了武当。
在蝴蝶谷，神医胡青牛让无忌加入明教，否则见死不救，小无忌记着张三丰的教诲，坚决不从，胡青牛其后发现小无忌中的是疑难杂症，决定先医好后再把他弄死。小无忌得到《子午针灸经》后，发现可以用“烈火丹”与“镇风丸”制成截心掌的解药。用柴刀去后山砍下竹枝制成竹针，其后从胡青牛口中得到以“青蛇＋防风”可得镇风丸，从书房的书经中得到“大蒜＋鹿茸”得烈火丹，合成解药后救好了常遇春。
这天圣手伽蓝简捷等三人负伤入谷求医，胡青牛自然也是见死不救，不久小无忌发现受伤的峨嵋派的纪晓芙及其女儿杨不悔，为了救纪晓芙，再次向胡青牛求教，得到解药是“寒潭白鱼”，又去砍了支竹枝，与鱼钓合成“无饵鱼钓”，将其放入物品栏的手中，再在柴房右上角的角落得到蚯蚓，组成“有饵鱼钓”，去后山的水潭中钓得“寒潭白鱼”，治好了纪晓芙。简捷三人见小无忌年纪轻轻有如此大的医术修为，苦苦哀求小无忌为其救治，小无忌只好一试。在迷宫中找到“蜂蜜”与“断血散”，并得到了药王神康海的经书，在房前的树下挖出蜈蚣与红蝎，加上酒合成了“二仙化毒膏”，解救了三人的痛苦。但是三人的病情反复无常，小无忌很是奇怪，这天发现一黑衣人在水中下毒，却是胡青牛的情人师妹王难姑，两人斗气几十年，这次又互斗毒药而倒下，来找麻烦的金花婆婆见此安然而去，小无忌随后用“牛黄＋血竭”调成牛黄血竭丸，救起两人，两人让小无忌造个假坟以骗金花婆婆，赠与三颗九转苍龙与三支千年雪参后飘然而去。
小无忌造完假坟后骗过了金花婆婆，此时灭绝师太出现，弟子丁敏君不知天高地厚向金花婆婆无理，被金花婆婆打飞，灭绝师太与金花婆婆对决（动画）。金花婆婆不敌倚天神剑离开。此时灭绝师太要纪晓芙回杨逍身边伺机杀杨逍，纪晓芙宁死不从，死于灭绝师太掌下。小无忌赶快拉着杨无悔逃走。
两孩童在半路遇上了昆仑派的少女詹春奉命追杀苏习之，原因只不过是因为苏习之无意见看到何太冲练剑。苏詹两人同时负伤，小无忌为了救两人，来到城镇里找齐“何首乌”、“燕窝”、“五味子”与“紫河车”四样物品（虽然药店的老板不在家，不过可以从街上那货郎中处购得）。苏两人醒来后自是感激不尽，小无忌见两人上昆仑，于是一齐同行。
在昆仑山上，掌门何太冲因为小妾五姑身中怪病全身浮肿而气恼，这时詹春向掌门推荐小无忌，小无忌发现病由金银血蛇引起，为了捉蛇，小无忌以“断肠草＋青陀罗花”制成“驱虫水”，以“鸡蛋＋灵脂兰”制成“醉蛇丹”，捉住两条金银血蛇，救了五姑。何太冲为此感激而送小无忌下山时，却被冲出来的大夫人班淑娴拦截，原来蛇是她所放，何太冲是个老婆奴，只好打算杀掉小无忌，此时杨逍出现，救出两个小孩童。小无忌把杨不悔的身世告诉了杨逍，随后独自下山，却被追来的班淑娴打下了悬崖。
