影片的最后一段，鹦鹉王想要当继承人，但是大舅公却说他想要男主当继承人，另外影片前段提到，只有大舅公的血脉才能听见“塔”的声音，可以看出，大舅公其实是非常在意继承人是不是他自己的血脉的。对应现实就是宫崎骏一直想培养自己的血脉即宫崎吾朗当继承人，甚至于这件事成为他的一个心结。可以说塔的世界就是隐喻所有血亲世袭制的产业。
影片最后大舅公还是继续劝男主当继承人，说找来了13块没有“恶意”的石头，叫他搭一个自己的“塔”。对应现实就是宫崎骏为了培养吾朗的监督才能，做出了极大的让步，允许他组建自己的团队，自己监督电影。
到这里其实我们已经可以理解，所谓“恶意”到底是什么，即是所有因血缘关系而带来的**压迫，更直白点说，就是所谓“父亲的阴影”。宫崎吾朗的监督生涯，其实也一直在尝试逃出这股“恶意”。
因此在影片最后的最后，男主还是拒绝了当继承人的请求，“恶意“支撑的世界崩溃了。这也正引出影片除了与自己和解外的另一个主题——人生不能被血缘所绑架。
影片中的男主前期就是因为执着于有血缘关系的生母，忽略、甚至敌视他身边另一位真心对他好的后妈，因此误入歧途。而在影片的后段，男主在经过一系列冒险之后，见到产房中的后妈，才终于打开了自己被血缘关系所绑架的真心，随着男主亲口呼唤后妈为妈妈，男主完成了真正的自我救赎，影片的主旨也在此体现。
这是宫崎骏的自我检讨，也是他的自我和解。
这是他在的“塔”即将崩塌之际，他给自己的血脉宫崎吾朗最后的道别。同时也是对人们一直关心的他的继承人问题给出的最终解答，血缘关系并不能绑架他人的人生，宫崎吾朗是不是自己的继承人，他想活出怎样的人生，由他自己决定。
同时这也是宫崎骏和所有观众的道别，和男主一样，他希望没有人会因为执着于他的离去而伤害自己，沉浸到另一个世界。他只希望所有人都像男主目送哇哈哈飘向空中往生一样，只是对他轻轻挥手就好。