主要分为以下几条：
一.广惠城际——莞惠城际、佛莞城际广惠城际铁路连接广州市、东莞市和惠州市，为珠三角城际快速轨道交通的放射线路之一，分为佛莞城际铁路和莞惠城际铁路两段建设。
二.穗深城际
2019年12月，穗深城际正式通车，这条城际的开通，把广州、东莞、深圳三城的脉络串联了起来。
作为广深首条城际轨道，穗深城际直接接驳多条轨道线路，对构建粤港澳大湾区1小时经济生活圈有着重要意义。
三.广深铁路：
广深铁路，是广东省内首条连接广州市、东莞市与深圳市之间的城际快速客运专线，为珠三角城际快速轨道交通的主干线路之一，也是中国东南沿海通道厦深铁路至广州、东莞两市中心城区的联络线。
四.广深客运专线（广深港高铁）：
广深港高铁，也是大家比较熟悉的一条线路，已于2018年9月23日通车运营。铁路北起广州南站、南至香港西九龙站，跨穗、莞、深、港三市，线路全长141千米，在东莞仅有1个虎门站。