从遥远的过去延续下来的光之巨人与黑暗巨人的战斗
在《ULTRAMAN》中登场的奈克斯特奥特曼=诺亚奥特曼和异生兽=THE ONE的战斗,被后来的《奈克瑟斯奥特曼》所继承,诺亚和黑暗扎基的战斗,从比《ULTRAMAN》和《奈克瑟斯奥特曼》时代还要早数万年以上的M80天蝎座球状星团开始。在那里,存在着具有高度智慧的生命体。
其母星被异生兽袭击时,光之巨人诺亚奥特曼出现,拯救了危机。但是,由于在那场战斗中消耗能量的诺亚陷入了沉睡,智慧生命体作为对抗异生兽的对策,诞生了模仿光之巨人的人造巨人“终极兵器·扎基”。之后,扎基知道自己是仿造品,对扭曲的自我觉醒的扎基,变成黑暗扎基而暴走。智慧生命体通过爆炸自己的母星来阻止危机,“光量子信息体”散落在宇宙中。
不久,其中一部分成为“来访者”飞到地球上后,在心灵感应中与人类取得了协奏,传达了母星的惨剧在地球上也会反复发生的事情。另一方面,包含了黑暗扎基的信息的「异生兽因子」也飞来,依附于来访者的研究的山冈一。得知同样是来访者的研究者西条博士的女儿凪继承了光后,杀害了博士,给凪种下了恐怖。
之后,变成蓝色发光体的异生兽飞到地球上,与有动贵文融合,变成了异生兽。作为红色发光体飞来的诺亚奥特曼也与真木舜一融合成为奥特曼,展开了激战。由于来访者创造的“忘川”,虽然将人们抹去异生兽的记忆,但忘川的屏障减弱,从忘川的残留细胞中再次诞生了异生兽。……一直到如扎基所料凪变成了奈克瑟斯,通过吸收光的能量,作为黑暗扎基复活,但是从凪手上继承了光的孤门一辉,变身奈克瑟斯—诺亚奥特曼,战神了黑暗扎基。
另外,在《奈克瑟斯》的剧中,由于没有描绘诺亚与孤门分离的样子,所以之后的详细情况不明,但超越空间存在的诺亚在《赛罗奥特曼THE MOVIE超决战!贝利亚银河帝国》中,展现了作为“别宇宙之神”的姿态。
由于黑暗扎基和异生兽的袭击,亲手爆破母星的智慧生命体=来访者,以前是人类的身姿,不过,成为光量子信息体分散到宇宙。在TLT的巨大水槽中,像水母一样的生物(照片),这是为了适应地球环境的一种形态。
在新宿的TheOne和奈克斯特奥特曼的激战后,为了忘记异生兽的恐怖,进一步抑制异生兽的实体化,根据来访者的技术,在世界各地启动了对异生兽出现控制系统“忘川”。但是,之后屏障减弱,又出现了异生兽(形象画)。
在来访者的星球上肆虐的黑暗扎基和异生兽们。在黑暗扎基的后方,发生了用于爆炸行星的武器爆炸(形象画)。