【林星纶暗中保护周秀英等贼首的做法一度成为了向荣用于攻击吉尔杭阿的政治工具，不过由于明面上林星纶处置较为妥当，加上上海之战中他展现出的能通夷情的才干和沪勇颇为优秀的战斗力，都让吉尔杭阿十分欣赏，才被吉尔杭阿保举了下来，未受周秀英逃亡一案的影响。
收复上海以后，吴健彰为了挽回自己的官途，继续督率船队和狼山镇总兵泊承升一起帮助吉尔杭阿运兵进攻镇江，林星纶则得以署理上海知县，在吉尔杭阿、吴健彰这些人全部前往镇江的时候，得以执掌上海军政大权。他立即联络各富户，募集巨款，扩充沪勇，又让华尔前往租界，大规模招揽西洋的冒险家作为教官，购置大批洋枪训练洋操，很快沪勇便被扩充至了近千人。租界方面也几次派人来联系林星纶，特别是法国方面，似乎很有兴趣编练一支华洋混合的保卫租界安全的部队。】

【枫亭之败福勇几乎全军覆没，萨定瓯总算是吸收到了一点教训，认识到没有充分训练过的军队上了战场后依然是被人屠杀的事实。痛定思痛的萨定瓯虽然尚未放弃对洋枪洋炮的追求，还是花了巨大的功夫去上海香港等处购买洋人军械，不过考虑到乱党近在眼前，远水救不了近火，他还是做了一定改变，模仿戚继光兵法和此时已展现出很高战斗力的湘军营制，编练了使用劈山炮、鸟铳和普通冷兵器的新军作为补充，起应急之用。
加上此次指挥作战的清军名将饶廷选也算是和萨定瓯有过不少交情的老朋友了，在他的配合下，重新成军的福勇终于有了慢慢练兵和逐步投入进行实战的机会，双方相互配合，在仙游濑溪击败乱党，毙敌三百余人，让萨定瓯逐步恢复了一定战斗的信心。之后萨定瓯还是采取保守态度，尽量避免野地浪战，小心翼翼作为饶廷选清军主力的辅助，缓步推进。乱党首领林俊眼见官军无懈可击，遂逐步转移兵力，利用饶廷选和萨定瓯十分持重的机会，突然行动，撤出了仙游和莆田境内，回师德化。清军随即追击至德化城郊，毙杀乌钱会首陈湖等人，林俊立足不住，进一步退入山区，凭险据守。
萨定瓯则利用从香港和上海运来的两门洋炮，昼夜不停轰击林俊据守的永春西部的帽顶山寨，林俊无可奈何，不得不选择了率部再度突围转移。在突围过程中总兵钟宝三、副将饶廷选、道台胡应泰等督率绿营围攻截击，重创乱党，追杀其首领黄有使、江水等人。林俊则逃往惠安联合邱二娘和普通乌白旗旗首朱三转往南安发展。
清军虽然在钟宝三、饶廷选率领绿营主力重兵围剿后取得了大量胜利，可由于天地会、红线会、小刀会等乱党在福建基础极为深厚，本地又素有械斗传统，民风彪悍，乱党此起彼伏，贼首林俊又游移不定，始终不能抓住其人，使得这边方平定，那边又起火，闽浙总督王懿德左支右绌，哀叹不断，福建用兵以来费帑将近二十万两，还是不能取得决定性胜利。
不过这种低烈度的战事倒是给了萨定瓯所部福勇的成长空间，萨定瓯本人完全不知兵，福勇训练状况也极为糟糕，此前屡屡沦为乱党肉票，他从上海和香港几次总共花费三万多两购置的军械也一次又一次的送给了林俊，为乱党补充了许多洋枪洋炮，但经过这么多惨痛的失败，萨定瓯也总算有了一定长进，起码懂得了一点，就是福勇现在的战斗力根本无法独立野战，只能作为绿营的补充，依靠火力优势负责摧毁乱贼工事而已。】

【西征军攻克武昌后，湖北全省风云变化，到处是起兵迎接太平军天兵的起义者，西征军统帅石祥祯和林绍章便分派各部攻略湖北各州县，于德安击败新任湖广总督台涌所率的八旗兵后将其驱逐到武胜关，而后又纵横荆襄，克取云梦、应城、应山、随州、安陆、荆门，直到曾天养带在龙会桥被荆州将军官文所阻挡后，太平军才稍稍停住了向西进攻的趋势（其时甚至已经有小股太平军渗透至宜昌乃至于四川境内了）。
在曾天养纵横荆襄时，石祥祯也亲自带领西征军主力部队攻略鄂中和鄂东地区，控制了鄂东南大片州县，以至于曾国藩发出“官兵到境，无土人为之向导，无米盐可供买办，人心之坏，实堪痛恨”的哀叹来。留守武昌的陈玉成和李佑苍则抓紧时间收集工匠、打造水师，李佑苍特别重视升级太平军水师的武备，他知道太平军水师看似多达万条战船，但其实多为民船经简易改装而已，在长江下游太平军的水师面对向荣的红单船已经出现了极大的劣势，曾国藩据说也在编练新水军，因此他极力说服陈玉成在武昌督造大船，以西征军原有水师为基础，编练了一支船只更加坚固高大的新水军出来。
当曾国藩指派朱孙贻、胡林翼、李可翎等部聚兵万人进攻金口时，指挥作战的陈玉成便和李佑苍相互配合，水陆并进，在金口两岸设置暗藏炮台，又以被淘汰下来的旧水师民船为诱饵在嘉鱼诱使湘军分兵后，引其水师进入金口炮台的射击范围当中，发炮击之。这支湘军部队虽然展现出了较此前李佑苍遇到的清军要坚强得多的战斗力，但由于其处于极端不利的位置，遭到太平军炮火单方面的打击，水师又堵在金口一带难以行动，后方粮草也被陈玉成派奇兵烧毁，因此虽然做了极其激烈的抵抗，但在血战一昼夜后还是溃败了下来。湘军南溃后，陈玉成、李佑苍立即分率水陆兵马沿途追击，于道中击毙清军名帅江忠义等人，重创清军。
不久陈玉成直接冲过洞庭湖，攻克宁乡，阵斩湘军训导储政躬等数十人，这时石祥祯正在经略鄂中，他便派林绍章率领援湘军沿途招揽湖北投军者，号称三万，大军浩浩汤汤一路南下至岳州大败常杰等部后到靖港同陈玉成会师后，分兵攻略靖港、湘潭，准备夹击克取长沙。】

【曾立昌北上以后，瓜州、镇江的太平军兵力大为削弱，余万清在北、吉尔杭阿在东，皆以重兵猬集压迫，一旦瓜州失陷或者吉尔杭阿将苏沪兵勇调至镇江参与围攻，太平军必然陷入异常惨烈的攻防战之中，将失去在野地会战寻求战机的机会了。此时最为重要的就是在红单船的压迫下，赶在吉尔杭阿率苏沪兵勇抵达镇江前，对余万清的江北绿营造成一次歼灭性的打击，才能扭转战略上太平军的不利形势。
为此杨秀清调韦昌辉从天京带兵东援镇江，又从芜湖和皖北调来秦日纲、李秀成、周胜坤等部，组建了一支强大的援军兵团。芜湖诸军由秦日纲率领，弃垒东进，救援瓜州，天京援军由韦昌辉率领，救援镇江。由于红单船掌握了江面的通行权，韦昌辉运兵不得不小心翼翼采用小船分批运送，为转移向荣和吉尔杭阿的注意力，他又派遣数百精兵化妆潜入苏南袭扰常州一带，让吉尔杭阿做出了太平军将优先东进截击苏沪兵勇的错误判断，主力援军则趁机在罗大纲水军的运送下，悄然开至了镇江两岸，在余万清发现太平军动向之前，大大厚实了镇江援军的兵力。韦昌辉带着北王府亲卫锐士二百余人首先赶到了韦志俊设在南山的大营，不久又独带随从数十人奔往北固山会见吴安国，韦昌辉为人极为谦和，他不在意吴安国地位卑微，采取了吴安国提出的策略，令罗大纲、韦志俊分率两队自两翼袭击和调动江北绿营，吴如孝择机突围出城直趋余万清大营动摇清军士气，随后留驻北固山的北王府亲兵精锐和吴安国所部便可以择机进攻被拉扯和调动开的余万清阵列了。
由于吉尔杭阿、虎嵩林、林星纶等部正驰往镇江，韦昌辉时不我待，决定立即行动，为此他将杨秀清在天京城内训练的骑兵六百人交给了韦志俊以便于其牵制余万清主力。罗大纲、韦志俊遂首先发难，分别在七里店和金鸡岭从两面夹击袭击清妖侧翼，余万清没有料到太平军的兵力得到韦昌辉援助后已经大为厚实，他见到罗、韦两部倾巢而出后，认为太平军援军兵力已经尽出，因此毫无防备，未留预备队，将全部兵力在金鸡岭一带展开同韦志俊鏖战，由于清军此时尚据有一定兵力优势，韦志俊首先吃紧，渐渐败退，清军守备王炳周纵兵追击，韦志俊立即下令骑兵部队回头反击，当场击毙了猝不及防的王炳周，重创清军士气。
与此同时，吴如孝见到北面围城军队被调动后，当即带着城内千余将士，出城突击余万清的金山大营，当时镇江城内守军一日半餐的日子已经过了数月之久，士卒疲敝不已，因此竟然仓惶之下无法打破大营，被金山大营中留守的数百清军所阻挡，而余万清此时也渐渐发觉到了太平军的战术动向，分派部队绕后抄袭吴如孝，并派马队疾驰往镇江进行侦察。眼看大局将破，韦昌辉还是紧紧捏着手中亲兵等待战机，吴安国便主动请战，由自己率领中十七军的老兄弟们救援吴如孝，韦昌辉不愿错过歼灭余万清的战机，因此决定只派吴安国所部数百人攻金山大营，他手中的北王府精锐继续作为预备队等待战机。
鉴于路途遥远，吴安国下令将士皆打好绑腿，每人发银钱，并在得到北王许诺后，答应破营后赏赐大批美酒（天国一般情况下禁酒），因此军心可用。吴安国自己更抱定置之死地而后生的决心，他当即率部下北固山，先阻击余万清派来救金山大营的援兵，枪炮排开，人人争先，清军一时难以得手，但战线也越拉越长，吴安国兵力薄弱的情况渐渐为清军所洞悉，清军遂分兵抄击其后，一时间形势危殆至极。关键时刻吴安国分兵二百人支援吴如孝，自己则在兵力被削弱且遭到抄击和围攻的情况下，就地环阵抵抗清军围攻，为韦昌辉争取了大量时间，虽然吴如孝未能打破金山大营，但韦昌辉见到余万清不断分兵，清军主力被拉扯散开后终于下定了决心，令亲兵下山突击金鸡岭，配合韦志俊前后夹击打破余万清主力部队。余万清在金鸡岭遭到反击后才发现太平军兵力远超其想象，他也当机立断，不做纠缠，带着标兵立即向北突围逃回江北大营，而金山大营和七里亭的其他清军则在余万清北逃后遭到腾出手的韦昌辉渐次歼灭，至此镇江北面清军受到重创，为下一步抵御吉尔杭阿做好了充分准备，且秦日纲、李秀成也在瓜州击退了托明阿，瓜镇形势大为好转。】

【蔡岭溃师以后，赣军险些被长毛一网打尽、全军覆没，李可翎号称江西干城的名誉也就此破产。此后他同江西本地官绅之间的矛盾越来越深厚，特别是他在曾国藩和陈启迈的政争之间站在曾国藩的一边，又在永修编练保甲、强行没收当地农夫土地，遂为陈启迈抓住了借口，以李可翎不能约束军纪、贪墨敛财等借口，解除了其帮办江西全省团练的差遣，夺取了赣勇和鄱阳湖水师的指挥权。
深为愤恨的李可翎对腐坏至极的江西官场彻底丧失信心，他说服了为人较为刚正的江忠义几兄弟带着两千老楚勇随他前往湖南、托庇于曾国藩，此外在离开江西前李可翎又从残余的赣勇中抽调精锐，和此前自己招揽亡命之徒组建的选锋营一起编成了选锋、先登、敢战三个营，再加上江忠义、江忠濬、江忠济的老楚营，他带着约四千军队前往湖北、驰援金口。
岳州知府贾亨晋、巴陵知县朱元燮及湘军大将朱孙贻、湖北道员胡林翼皆率众赴金口抵御发匪的南下，李可翎麾下只有镇篁兵千总宋祖明受胡林翼的委派前往凤凰招募苗兵没有参与金口之战，逃过了一劫。仓促集结起来的清军并没有做好战斗的准备，特别是李可翎所部从江西被当地文武驱赶出来，一路上缺粮少饷，士兵饥寒交迫，千里迢迢赶到金口时，备战状况可说是极差了。而长毛则在攻克武昌后缴获了数量繁多的军资粮秣辎重，饷械充沛，还由于曾国藩为保湖南没有将湘军水师派往湖北作战，致使发匪在金口还由于陈玉成、李佑苍的苦心经营具备了水师优势。
金口之战，李可翎部以饥寒交迫的士卒和欠饷数月的后勤状况，拼死一战，血战一日一夜，前者死、后者继，特别是江忠源的堂弟江忠义一介文人之身在关键时刻亲上前线砍到长发贼数人激愤士气，溃兵见统领亲自持刀作战，士气复振，枪炮复续，毙杀发匪不计其数，终因发匪在金口两岸藏有暗置炮台数处，连环发炮不止，李可翎所部才终于抵挡不住，在奋战一日一夜后全线溃退，逃往岳州，沿途老楚勇统领江忠义被发匪鸟铳击伤，抵湖南不久即因伤病死于营中，全军为之丧胆。
曾国藩为了振作这支残兵的士气，请加李可翎从五品候补知州，并授权他在岳州就地募勇充实军队，从此这支以湘勇、老楚勇和江西团练混编起来的构成颇为复杂的军队，便以李可翎的字号慎之为名，称为慎军。慎军经岳州补充后，编有五个营，约近三千兵力，在发匪破金口、过洞庭顺流直入湖南后，配合王鑫所部湘军尾追发匪至靖港抄击其后。】

陈济
罗苾芬是太平军地官又正丞相，又理北殿一应事务，可以说是韦昌辉乃至整个太平军财政的大管家。如此重要的人物潜入捷勇营中大肆活动，不可能不引起清廷的察觉。杨秀清这样做实在是太过孟浪了，好在还可以用走私的理由搪塞之。陈济察觉到这一点后，立刻向罗苾芬提出自己的计划（见密令），然后派人通过秘密交通线将其送回天京城去。隔日，陈济便阖营大索，抓捕几个编入捷勇的太平军俘虏（实不知情）和一些到太平军那里参加走私贸易的捷勇（亦是不甚知情之人），拷打出口供，再将从罗苾芬那里得到的若干宣传品、资金等物栽赃到这些人身上，编造出一个“捷勇内部走私贩子里通敌方财经总管罗苾芬，擅自贩卖违禁物事”的案件，抢先报告向荣，并且还要假装积极搜捕罗苾芬。这样一来，再有人告密说陈济里通罗苾芬也没什么用了，因为此案已成铁案。
另一方面，借此案加紧对捷勇内部拜上帝教信徒的管理和控制，借罗苾芬之口告诉他们：现在是黎明前的黑暗，清妖抓人说明他们的末日就要来临了，马上就会有意想不到的天将率领天兵来解救众弟兄。大家现在暂时转入单线联系，暂停积极活动，等待天将出世唤醒整个捷勇内部的拜上帝教组织。
同时，对身边天地会或者同一家族出身的亲信则用重金、厚恩、江湖义气以及宗族思想稳住他们，时时刻刻跟这些人在一起。有空的时候，跟这些人一起吃喝，时刻掌握他们的思想动向，向他们灌输“朝廷不会用人，文武百官都多是贪庸无能之辈，只有跟着我铁枪济走才有出路”等等，确保他们忠诚于陈济个人。
在此期间，继续跟张国梁、冯子材密切往来，多跟他们走动、宴饮，特别是借升官的机会请他们到我驻守的钟山炮台里面来喝酒。常来常往，热情招待，让他们感到来钟山炮台是非常安全、舒适、愉快的事情。若有太平军来犯，也要身先士卒，指挥部队抵抗，但要注意不离开钟山炮台。

萨定瓯
1.此次福勇重建取得不错的成绩，这证明了湘军战术的优势所在～故定瓯决定福勇全军（除西洋火器队外）一律用湘军之法进行训练～同时加强白刃战的训练～
2.拜会副将饶廷选，请求他派些作战经验丰富的士兵或者军官指导福勇训练工作～
3.这次的战斗，使萨定瓯认识到福勇目前只能依靠火力优势配合官军攻打敌军～故对福勇计划做出以下调整～
a.对敌军采取采取激将计，使其怒而兴师，行军至我军伏击处～
b.然后利用火力优势攻打敌军头尾处，阻断敌军的退路～
c.然后配合官军，利用手中的火力优势打败甚至歼灭敌军～
4.继续和英法的有关人员搞好关系～
5.继续往敌军内部安插人员，以掌握有关情报～同时散布谣言，离间敌军关系～
6.向王懿德提出建议：对于目前福建的动乱，建议剿抚并用～一方面围剿会党以达到震慑他们的目的～另一方面则采取只诛杀首恶和骨干的方针；因而建议王懿德颁布命令：凡是会党任何人（包括首恶亲属），只要活捉林俊或者拿林俊人头，一律赦免罪行，赏赐钱财、官身～以达到分化敌军，诛灭首恶的目的，才有机会平定福建动乱～
7.拜会洋行，商讨兴建机器纺织作坊的事宜～

常杰：
两连败使得常杰不得不反思自己，上次是因为满汉矛盾，此次则是自己没有运筹好，不过国势艰难，但是只要我一息尚存，明教火种不会灭
1撰写《持久战》，呈给张亮基和曾国藩：1长毛屡战屡胜，似乎无法阻挡，官民叛逃者甚众，但是长毛结邪教蛊惑人心，排除名教，自古无以邪教成大事者2我以数百万士绅为骨干，统领数亿农人，顺天理，顺民心足以压服邪教3长毛一教二神，一国二主，未闻有不败者，坚定曾国藩张亮基信心
2亲自招募3000兵扩充我军实力，编为孟字营，由刘松山帮办军务，继续严格训练，特别是土工作业、队列和炮术
3有密令

李可翎
新军难战靖港难守，厚赏手下将士以安军心，向曾国藩求援，同时做好撤往乌山的准备。
有密令

张云毅
向李开芳、吉文元、曾立昌建议：
1、现北伐军编制残破，在捻党的掩护下，两军在汝州山区一带汇合后进行短暂的整编，将受伤的难行的将士交由捻党分散转移回天国控制区，分配装备、重整编制、厘清指挥体系，由官职最高的地官正丞相李开芳担任统帅。
2、整编完成后，清军马队已至，全军沿伏牛山脉东进豫东，再向南阳挺进做欲与湖北的西征军汇合迹象，吸引清军围堵，实则虚晃一枪、利用僧格林沁击败太平军骄傲的心态和咸丰头子畏惧湖北彻底崩溃急切让各清军追击的可能性，设法在山谷险地伏击清军。
3、无论伏击是否实行或成败，继续散布假消息，以偏师伪装主力南下，主力伪装东进偏师，制造我军虚出豫东、实则遁入南阳的假象，主力沿淮河攻入皖北；
4、进入皖北后清军反应过来，北有胜保马队，南有江北大营，河南僧格林沁部追击。在皖北联系捻军张乐行，提议太平军在皖北吸引清军主力之机，捻军可以出兵淮安清江浦，夺取粮仓，击破清军封锁后还可以回师伏击南下的胜保马队。5、无论捻军是否合作，我军利用清军对大城市的重视调动清军，曾立昌部熟稔淮河地貌，以张云毅部水鬼配合曾立昌部从淮河积沙严重处渡口夺取渡船，以船为桥，渡过淮河。
6、在渡过淮河后做出欲南下通过芜湖渡过长江的迹象，吸引江北大营驰援堵截我军渡江，实则沿北伐旧路从江北大营后寨攻击江北大营，重新占据扬州，寻机夺取清军水师红单船。
6、通报天京，建议在江北大营正面造声势掩护北伐军的攻势。
7、实在没法了真南下，走南阳攻襄阳或走信阳攻武胜关与西征军汇合

林星纶
这次当上上海知县让林星纶获得了扩充势力的好机会，于是决定利用这个好机会获取大量钱财扩充沪军的力量
1利用上海知县这个肥差绞尽脑汁隐秘的获取财富，比如帮助因为长毛逃亡过来的地主和富户建房子发展房地产业来赚钱
2与租界的洋人商量在租界投资建设军工厂，本人占有一定量的股份。生产出来的武器一部分由沪军低价购买，另一部分则出售到国内。
3同意法国人的邀请，用沪军的一部分来建立一支华洋混合的部队，通过观摩洋人训练的方法和获得洋***练制度来帮助沪军进行进一步的升级
4向洋人购买后装野战炮和攻城炮组建炮营。再通过获取洋人国内标准的步兵操典来对沪军进行严格的西洋式训练，并统一制服严明军纪。提高沪军的真实战斗力

过天星吴安国：
1.既已解围，我们应该把战线拉开，首先去抢占城东的烟墩山、圌山一带，放扎军马，以逸待劳静候小心谨慎的吉尔杭阿到来，吉尔杭阿胆小如鼠，必定会严防偷袭，我们只要与他相持，把他的兵锋驱赶在镇江地域外就好了。如能提前抢到二处，我们可借势扫除孤立无援的丹徒、丹阳、句容等地，取粮接济镇江，截断威胁江南大营的侧后方，亦可进行试探性牵制，调开清妖围攻天京的妖兵。也可向南撕开一道口子，威胁膏腴的苏南诸府。从而调动清妖满地救援，拉出破绽。
2.抑或是抢占世叶，缩小渡江距离，在沙洲西北故作声势，准备战船，做出似乎围魏救赵要攻取仪征江北大营的态势，实则调虎离山，却是北上去解瓜州之围，然后再放出小股部队，虚张声势，做出西进突击江北大营的态势，实则去光复扬州，江都，高邮等地，取粮接济镇江。加固镇江城防。
3.世叶沙洲东侧据北岸东岸均不足二里地，可筑起三处炮台，各放屯军成三角形散落在三岸，荡清江面，截断妖军红单船的航道。

李佑苍：
1、作战计划
2、在城陵矶一线加紧防御，以备不测，同时也可以让那边的主将看出新兄弟们的品质，分别对阵下药，以固人心。
3、在武昌继续铸炮造枪，将其打造为一个军事工业基地。

【常杰、刘长佑在岳州大败溃回长沙后，一时间几乎心灰意冷，但曾国藩深知此时湖南和湘潭的存亡关系东南大局，因此竭力整顿部队，且自广州购置的洋铁炮和新锐战船已经成军，编为两营水师，成为了曾国藩决定在湘潭和林绍章决战的最大底牌。此时塔齐布正率军在城外高岭发匪所建木城附近同林绍章血战，湘军屡扑屡进，五路反击，烧毁了林绍章所建木城，阻遏了其北攻长沙的计划，曾国藩闻讯大喜，立即将正在长沙整备的罗泽南、常杰、刘长佑、李续宾等五千湘军最后留守长沙的兵力也全部派往了湘潭助战，同时还将其倚为杀手锏的彭玉麟之新锐水师也遣往湘潭水道作战。
常杰率部抵达后，立即利用自己长期主政湘潭的优势，联络地方士绅团练发难，并在抵达湘潭附近的第二夜，便遣刘松山率锐士百人在湘潭士绅的内应配合下潜入城内，焚毁了发匪大批粮草和船只，使得林绍章很快面临米盐皆尽的情况，不得不分兵攻略湘东州县以收集粮秣物资，为湘军反攻提供了有利基础。
次日彭玉麟、杨载福督率新锐水师抵达，立即出击，大破发匪由千条民船改装来的水军，攻入文昌阁附近，发炮攻城，机会将林绍章手上的船只全部摧毁，发匪仅余小船三十多条而已。塔齐布趁机派兵渡江，四面合围，将湘潭城完全包围起来进行猛攻。林绍章连战失利，眼见有遭到合围的危险，又派兵在窖湾构筑望楼工事，试图渐次撤出湘潭。罗泽南的门生弟子李续宾督率一营人马，勇猛异常，乘上游发匪收集大船时猛攻窖湾，将林绍章修筑的工事全部烧毁，截断其退路，不久李可翎、王鑫又带领自靖港败退的残兵抵达助战，江忠濬率楚勇先登夺城，塔齐布随即督率各军直入城内，在夜间和发匪爆发了异常惨烈的巷战。
眼见大局已去，林绍章率部突围，由于北路被李续宾和彭玉麟封锁，他不得不沿陆路逃亡，常杰早有准备，让刘松山率数百人伏兵于团山镇阻击林绍章，不久王鑫、刘长佑又率部从后方追来，发匪在撤退中遭到阻击，毫无防备，几乎全军溃散，死伤数千人之多。但驻在靖港的李佑苍督率发匪新造水师星夜南下夺占宁乡，派兵偷袭长沙，其时长沙城中空虚无备，仅有巡抚骆秉章和曾国藩等人临时动员的家仆数百人而已，不得已曾国藩不得不从湘潭调兵急救长沙，陈玉成又率部赶到桥头镇接应林绍章，常杰才不得不放弃了之后对于发匪余部的追击了。不过即使如此，湘潭之战前后毙杀发匪万余人，重创其部，几获全胜，成为了自江忠源蓑衣渡一战以来清军对发匪取得的最大胜利，使得湘军声名大噪，曾国藩岌岌可危的地位也因此稳固。】

【经历了一年多极端艰苦而血腥的北伐战事后，在付出了林凤祥和数千忠勇老兄弟战死的代价后，北伐军终于在荥阳同曾立昌会师，就此结束了北伐计划，开始了回家之路。但是，在荥阳会师后，北伐军上下将士虽然士气大增，但由于长期的消耗，此时总兵力还是仅不足二万人，而四面包抄来追的僧格林沁、胜保、张亮基、袁甲三等部的兵力则要强大的多。考虑到北伐军编制残破，损耗严重且疫病横行的情况，坚忍不拔、性情温和的曾立昌很识大局，拥护了李开芳执掌全军指挥权，统一了两支部队的指挥架构，南下进入汝州山区进行了短暂的休整，稍稍恢复力量后，便立即东进豫东。
李开芳率领北伐军做出了进攻南阳的事态，试图通过此时湖北的危局，引诱清军误判北伐军的动向，然而胜保虽然上了勾，但僧格林沁毫不放过一点蛛丝马迹，始终紧咬不放。吉文元和张云毅率部殿后，在清河驿试图利用僧格林沁的猪突猛进进行伏击，但由于僧王所部马队甚多，精骑四出，始终掌握着战场的主动权，伏击打掉其先头部队后，太平军无法咬住其主力进行歼灭作战，无奈之下只能放弃伏击转为截击，且战且退，配合获得亳州捻军接应的北伐军主力退入皖北。
进入安徽境内以后，形势骤然一变，北伐军得到了江淮捻党的极大规模响应，后勤状况大为转好，加之气候风土的变化也让北伐军将士更为适应，一时间北伐军进军神速，直迫淮安。但安徽布政使袁甲三颇有才干，他组织皖北团勇四处截击太平军的进军，在固镇成功挡住了李开芳的脚步，北伐军主力猛攻数日未能冲开阵地东进，与此同时回过神来的僧格林沁和胜保已经从北、西两面包抄过来，形势再度转危，不得已之下李开芳选择分兵绕道而行，他自率一部留在皖北机动牵制僧格林沁，曾立昌另率一部在张云毅的配合，狂飙猛进向淮河岸边突进，抵达河岸后立即搜集船只利用水道迅速东下，十余日间即从淮安府顺利南下进入了扬州境内，此后更配合秦日纲兵团力破江北大营，立下了赫赫战功。
但留在皖北牵制清军的李开芳形势则大为困难，他试图南进怀远，打通和庐州太平军之间的联系，但却在固镇和怀远之间遭到了皖北团练的伏击，本人身负重伤，难以指挥部队作战，由此太平军的灵活机动受到了很大限制，很快便被发现这一情况的僧格林沁率部包围了下来。在僧王马队的分割包围之下，太平军虽然就地修筑木城坚守，但激战十七天后终由于粮秣耗尽，不得不尝试突围，突围过程中，本已身负重伤的李开芳未清军俘虏，吉文元率领残兵千人进至蚌埠集后被袁甲三诱杀。】